Protein–RNA interactions for Protein: Q3URI6

Zfp560, Zinc finger protein 560, mousemouse

Predictions only

Length 754 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zfp560Q3URI6 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Zfp560Q3URI6 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Zfp560Q3URI6 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Zfp560Q3URI6 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Zfp560Q3URI6 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Zfp560Q3URI6 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Zfp560Q3URI6 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Zfp560Q3URI6 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Zfp560Q3URI6 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Zfp560Q3URI6 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Zfp560Q3URI6 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Zfp560Q3URI6 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Zfp560Q3URI6 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Zfp560Q3URI6 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Zfp560Q3URI6 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Zfp560Q3URI6 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Zfp560Q3URI6 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Zfp560Q3URI6 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Zfp560Q3URI6 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Zfp560Q3URI6 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Zfp560Q3URI6 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Zfp560Q3URI6 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Zfp560Q3URI6 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Zfp560Q3URI6 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
Zfp560Q3URI6 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
Zfp560Q3URI6 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
Zfp560Q3URI6 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Zfp560Q3URI6 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Zfp560Q3URI6 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Zfp560Q3URI6 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Zfp560Q3URI6 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Zfp560Q3URI6 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Zfp560Q3URI6 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Zfp560Q3URI6 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Zfp560Q3URI6 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Zfp560Q3URI6 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Zfp560Q3URI6 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Zfp560Q3URI6 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Zfp560Q3URI6 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Zfp560Q3URI6 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Zfp560Q3URI6 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Zfp560Q3URI6 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Zfp560Q3URI6 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Zfp560Q3URI6 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Zfp560Q3URI6 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Zfp560Q3URI6 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Zfp560Q3URI6 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Zfp560Q3URI6 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Zfp560Q3URI6 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Zfp560Q3URI6 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Zfp560Q3URI6 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Zfp560Q3URI6 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Zfp560Q3URI6 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Zfp560Q3URI6 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Zfp560Q3URI6 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Zfp560Q3URI6 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Zfp560Q3URI6 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Zfp560Q3URI6 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Zfp560Q3URI6 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
Zfp560Q3URI6 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Zfp560Q3URI6 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
Zfp560Q3URI6 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Zfp560Q3URI6 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Zfp560Q3URI6 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Zfp560Q3URI6 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Zfp560Q3URI6 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Zfp560Q3URI6 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Zfp560Q3URI6 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Zfp560Q3URI6 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Zfp560Q3URI6 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
Zfp560Q3URI6 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Zfp560Q3URI6 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Zfp560Q3URI6 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Zfp560Q3URI6 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Zfp560Q3URI6 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Zfp560Q3URI6 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC22.58■■□□□ 1.2
Zfp560Q3URI6 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Zfp560Q3URI6 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Zfp560Q3URI6 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Zfp560Q3URI6 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Zfp560Q3URI6 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Zfp560Q3URI6 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Zfp560Q3URI6 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Zfp560Q3URI6 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Zfp560Q3URI6 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Zfp560Q3URI6 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Zfp560Q3URI6 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Zfp560Q3URI6 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Zfp560Q3URI6 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Zfp560Q3URI6 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Zfp560Q3URI6 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Zfp560Q3URI6 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Zfp560Q3URI6 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
Zfp560Q3URI6 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Zfp560Q3URI6 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Zfp560Q3URI6 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Zfp560Q3URI6 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
Zfp560Q3URI6 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Zfp560Q3URI6 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Zfp560Q3URI6 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.1 ms