Protein–RNA interactions for Protein: Q3UQS8

Rbm20, RNA-binding protein 20, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,199 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rbm20Q3UQS8 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Rbm20Q3UQS8 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Rbm20Q3UQS8 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Rbm20Q3UQS8 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
Rbm20Q3UQS8 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Rbm20Q3UQS8 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Rbm20Q3UQS8 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Rbm20Q3UQS8 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Rbm20Q3UQS8 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Rbm20Q3UQS8 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Rbm20Q3UQS8 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Rbm20Q3UQS8 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Rbm20Q3UQS8 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Rbm20Q3UQS8 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Rbm20Q3UQS8 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Rbm20Q3UQS8 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Rbm20Q3UQS8 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Rbm20Q3UQS8 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Rbm20Q3UQS8 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Rbm20Q3UQS8 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Rbm20Q3UQS8 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Rbm20Q3UQS8 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Rbm20Q3UQS8 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Rbm20Q3UQS8 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Rbm20Q3UQS8 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Rbm20Q3UQS8 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Rbm20Q3UQS8 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
Rbm20Q3UQS8 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Rbm20Q3UQS8 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Rbm20Q3UQS8 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Rbm20Q3UQS8 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Rbm20Q3UQS8 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Rbm20Q3UQS8 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Rbm20Q3UQS8 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Rbm20Q3UQS8 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Rbm20Q3UQS8 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Rbm20Q3UQS8 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Rbm20Q3UQS8 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Rbm20Q3UQS8 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Rbm20Q3UQS8 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Rbm20Q3UQS8 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Rbm20Q3UQS8 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Rbm20Q3UQS8 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Rbm20Q3UQS8 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Rbm20Q3UQS8 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
Rbm20Q3UQS8 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Rbm20Q3UQS8 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Rbm20Q3UQS8 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Rbm20Q3UQS8 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Rbm20Q3UQS8 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Rbm20Q3UQS8 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Rbm20Q3UQS8 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Rbm20Q3UQS8 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Rbm20Q3UQS8 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Rbm20Q3UQS8 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Rbm20Q3UQS8 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Rbm20Q3UQS8 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Rbm20Q3UQS8 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Rbm20Q3UQS8 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Rbm20Q3UQS8 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Rbm20Q3UQS8 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Rbm20Q3UQS8 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Rbm20Q3UQS8 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Rbm20Q3UQS8 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Rbm20Q3UQS8 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Rbm20Q3UQS8 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Rbm20Q3UQS8 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Rbm20Q3UQS8 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Rbm20Q3UQS8 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Rbm20Q3UQS8 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Rbm20Q3UQS8 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Rbm20Q3UQS8 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Rbm20Q3UQS8 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Rbm20Q3UQS8 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Rbm20Q3UQS8 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
Rbm20Q3UQS8 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Rbm20Q3UQS8 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Rbm20Q3UQS8 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
Rbm20Q3UQS8 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Rbm20Q3UQS8 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Rbm20Q3UQS8 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Rbm20Q3UQS8 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Rbm20Q3UQS8 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Rbm20Q3UQS8 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Rbm20Q3UQS8 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Rbm20Q3UQS8 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Rbm20Q3UQS8 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Rbm20Q3UQS8 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Rbm20Q3UQS8 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Rbm20Q3UQS8 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Rbm20Q3UQS8 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Rbm20Q3UQS8 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Rbm20Q3UQS8 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Rbm20Q3UQS8 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Rbm20Q3UQS8 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Rbm20Q3UQS8 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Rbm20Q3UQS8 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Rbm20Q3UQS8 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Rbm20Q3UQS8 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
Rbm20Q3UQS8 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC24.08■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.7 ms