Protein–RNA interactions for Protein: Q3UQ97

Gm5460, Predicted gene 5460, mousemouse

Predictions only

Length 254 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm5460Q3UQ97 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Gm5460Q3UQ97 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Gm5460Q3UQ97 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Gm5460Q3UQ97 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Gm5460Q3UQ97 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Gm5460Q3UQ97 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Gm5460Q3UQ97 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Gm5460Q3UQ97 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Gm5460Q3UQ97 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Gm5460Q3UQ97 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
Gm5460Q3UQ97 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Gm5460Q3UQ97 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Gm5460Q3UQ97 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Gm5460Q3UQ97 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Gm5460Q3UQ97 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Gm5460Q3UQ97 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Gm5460Q3UQ97 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Gm5460Q3UQ97 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Gm5460Q3UQ97 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
Gm5460Q3UQ97 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Gm5460Q3UQ97 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Gm5460Q3UQ97 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
Gm5460Q3UQ97 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Gm5460Q3UQ97 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Gm5460Q3UQ97 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Gm5460Q3UQ97 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Gm5460Q3UQ97 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Gm5460Q3UQ97 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Gm5460Q3UQ97 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Gm5460Q3UQ97 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Gm5460Q3UQ97 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Gm5460Q3UQ97 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
Gm5460Q3UQ97 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Gm5460Q3UQ97 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Gm5460Q3UQ97 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Gm5460Q3UQ97 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Gm5460Q3UQ97 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Gm5460Q3UQ97 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Gm5460Q3UQ97 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Gm5460Q3UQ97 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Gm5460Q3UQ97 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Gm5460Q3UQ97 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Gm5460Q3UQ97 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Gm5460Q3UQ97 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
Gm5460Q3UQ97 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Gm5460Q3UQ97 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
Gm5460Q3UQ97 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
Gm5460Q3UQ97 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Gm5460Q3UQ97 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Gm5460Q3UQ97 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
Gm5460Q3UQ97 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Gm5460Q3UQ97 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
Gm5460Q3UQ97 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Gm5460Q3UQ97 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Gm5460Q3UQ97 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Gm5460Q3UQ97 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Gm5460Q3UQ97 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Gm5460Q3UQ97 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Gm5460Q3UQ97 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Gm5460Q3UQ97 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Gm5460Q3UQ97 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Gm5460Q3UQ97 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Gm5460Q3UQ97 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Gm5460Q3UQ97 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Gm5460Q3UQ97 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Gm5460Q3UQ97 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Gm5460Q3UQ97 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Gm5460Q3UQ97 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Gm5460Q3UQ97 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Gm5460Q3UQ97 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Gm5460Q3UQ97 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Gm5460Q3UQ97 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Gm5460Q3UQ97 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Gm5460Q3UQ97 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Gm5460Q3UQ97 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Gm5460Q3UQ97 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Gm5460Q3UQ97 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Gm5460Q3UQ97 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Gm5460Q3UQ97 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Gm5460Q3UQ97 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Gm5460Q3UQ97 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Gm5460Q3UQ97 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Gm5460Q3UQ97 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Gm5460Q3UQ97 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Gm5460Q3UQ97 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Gm5460Q3UQ97 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Gm5460Q3UQ97 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Gm5460Q3UQ97 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Gm5460Q3UQ97 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Gm5460Q3UQ97 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Gm5460Q3UQ97 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Gm5460Q3UQ97 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Gm5460Q3UQ97 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
Gm5460Q3UQ97 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Gm5460Q3UQ97 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Gm5460Q3UQ97 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Gm5460Q3UQ97 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Gm5460Q3UQ97 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Gm5460Q3UQ97 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Gm5460Q3UQ97 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
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