Protein–RNA interactions for Protein: Q3UM18

Lsg1, Large subunit GTPase 1 homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 644 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lsg1Q3UM18 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Lsg1Q3UM18 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Lsg1Q3UM18 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Lsg1Q3UM18 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Lsg1Q3UM18 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Lsg1Q3UM18 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Lsg1Q3UM18 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Lsg1Q3UM18 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Lsg1Q3UM18 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Lsg1Q3UM18 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Lsg1Q3UM18 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Lsg1Q3UM18 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Lsg1Q3UM18 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Lsg1Q3UM18 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Lsg1Q3UM18 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Lsg1Q3UM18 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Lsg1Q3UM18 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Lsg1Q3UM18 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Lsg1Q3UM18 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
Lsg1Q3UM18 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Lsg1Q3UM18 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Lsg1Q3UM18 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Lsg1Q3UM18 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Lsg1Q3UM18 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Lsg1Q3UM18 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Lsg1Q3UM18 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Lsg1Q3UM18 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Lsg1Q3UM18 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Lsg1Q3UM18 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Lsg1Q3UM18 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Lsg1Q3UM18 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Lsg1Q3UM18 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Lsg1Q3UM18 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Lsg1Q3UM18 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Lsg1Q3UM18 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Lsg1Q3UM18 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Lsg1Q3UM18 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Lsg1Q3UM18 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Lsg1Q3UM18 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Lsg1Q3UM18 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Lsg1Q3UM18 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
Lsg1Q3UM18 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Lsg1Q3UM18 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Lsg1Q3UM18 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
Lsg1Q3UM18 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Lsg1Q3UM18 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
Lsg1Q3UM18 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Lsg1Q3UM18 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
Lsg1Q3UM18 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Lsg1Q3UM18 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Lsg1Q3UM18 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Lsg1Q3UM18 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Lsg1Q3UM18 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Lsg1Q3UM18 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Lsg1Q3UM18 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Lsg1Q3UM18 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
Lsg1Q3UM18 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Lsg1Q3UM18 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Lsg1Q3UM18 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Lsg1Q3UM18 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Lsg1Q3UM18 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Lsg1Q3UM18 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Lsg1Q3UM18 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Lsg1Q3UM18 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Lsg1Q3UM18 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Lsg1Q3UM18 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Lsg1Q3UM18 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Lsg1Q3UM18 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Lsg1Q3UM18 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Lsg1Q3UM18 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Lsg1Q3UM18 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Lsg1Q3UM18 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Lsg1Q3UM18 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Lsg1Q3UM18 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Lsg1Q3UM18 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Lsg1Q3UM18 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Lsg1Q3UM18 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Lsg1Q3UM18 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Lsg1Q3UM18 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Lsg1Q3UM18 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Lsg1Q3UM18 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Lsg1Q3UM18 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Lsg1Q3UM18 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Lsg1Q3UM18 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Lsg1Q3UM18 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Lsg1Q3UM18 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Lsg1Q3UM18 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Lsg1Q3UM18 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
Lsg1Q3UM18 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Lsg1Q3UM18 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Lsg1Q3UM18 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Lsg1Q3UM18 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Lsg1Q3UM18 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Lsg1Q3UM18 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Lsg1Q3UM18 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Lsg1Q3UM18 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Lsg1Q3UM18 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Lsg1Q3UM18 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Lsg1Q3UM18 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Lsg1Q3UM18 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
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