Protein–RNA interactions for Protein: Q3UL53

Crxos, Cone-rod homeobox, opposite strand, mousemouse

Predictions only

Length 246 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CrxosQ3UL53 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CrxosQ3UL53 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CrxosQ3UL53 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
CrxosQ3UL53 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
CrxosQ3UL53 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CrxosQ3UL53 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
CrxosQ3UL53 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
CrxosQ3UL53 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
CrxosQ3UL53 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
CrxosQ3UL53 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
CrxosQ3UL53 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
CrxosQ3UL53 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CrxosQ3UL53 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CrxosQ3UL53 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CrxosQ3UL53 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CrxosQ3UL53 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CrxosQ3UL53 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CrxosQ3UL53 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CrxosQ3UL53 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
CrxosQ3UL53 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CrxosQ3UL53 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CrxosQ3UL53 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CrxosQ3UL53 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CrxosQ3UL53 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CrxosQ3UL53 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CrxosQ3UL53 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CrxosQ3UL53 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
CrxosQ3UL53 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CrxosQ3UL53 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CrxosQ3UL53 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
CrxosQ3UL53 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
CrxosQ3UL53 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CrxosQ3UL53 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CrxosQ3UL53 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CrxosQ3UL53 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CrxosQ3UL53 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CrxosQ3UL53 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CrxosQ3UL53 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CrxosQ3UL53 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CrxosQ3UL53 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CrxosQ3UL53 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
CrxosQ3UL53 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CrxosQ3UL53 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CrxosQ3UL53 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CrxosQ3UL53 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CrxosQ3UL53 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CrxosQ3UL53 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CrxosQ3UL53 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CrxosQ3UL53 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CrxosQ3UL53 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CrxosQ3UL53 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CrxosQ3UL53 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CrxosQ3UL53 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CrxosQ3UL53 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CrxosQ3UL53 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CrxosQ3UL53 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CrxosQ3UL53 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CrxosQ3UL53 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CrxosQ3UL53 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CrxosQ3UL53 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CrxosQ3UL53 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CrxosQ3UL53 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CrxosQ3UL53 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CrxosQ3UL53 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CrxosQ3UL53 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CrxosQ3UL53 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CrxosQ3UL53 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CrxosQ3UL53 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CrxosQ3UL53 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CrxosQ3UL53 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CrxosQ3UL53 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CrxosQ3UL53 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CrxosQ3UL53 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CrxosQ3UL53 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
CrxosQ3UL53 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CrxosQ3UL53 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CrxosQ3UL53 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CrxosQ3UL53 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CrxosQ3UL53 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CrxosQ3UL53 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CrxosQ3UL53 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CrxosQ3UL53 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CrxosQ3UL53 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CrxosQ3UL53 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CrxosQ3UL53 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CrxosQ3UL53 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CrxosQ3UL53 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
CrxosQ3UL53 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CrxosQ3UL53 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CrxosQ3UL53 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CrxosQ3UL53 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CrxosQ3UL53 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CrxosQ3UL53 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CrxosQ3UL53 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CrxosQ3UL53 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
CrxosQ3UL53 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CrxosQ3UL53 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
CrxosQ3UL53 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CrxosQ3UL53 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CrxosQ3UL53 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.7 ms