Protein–RNA interactions for Protein: Q3UGR5

Hdhd2, Haloacid dehalogenase-like hydrolase domain-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 259 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hdhd2Q3UGR5 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Hdhd2Q3UGR5 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Hdhd2Q3UGR5 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Hdhd2Q3UGR5 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Hdhd2Q3UGR5 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
Hdhd2Q3UGR5 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Hdhd2Q3UGR5 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Hdhd2Q3UGR5 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Hdhd2Q3UGR5 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Hdhd2Q3UGR5 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Hdhd2Q3UGR5 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Hdhd2Q3UGR5 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Hdhd2Q3UGR5 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Hdhd2Q3UGR5 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Hdhd2Q3UGR5 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Hdhd2Q3UGR5 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Hdhd2Q3UGR5 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Hdhd2Q3UGR5 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Hdhd2Q3UGR5 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Hdhd2Q3UGR5 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Hdhd2Q3UGR5 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Hdhd2Q3UGR5 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Hdhd2Q3UGR5 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Hdhd2Q3UGR5 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Hdhd2Q3UGR5 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Hdhd2Q3UGR5 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Hdhd2Q3UGR5 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
Hdhd2Q3UGR5 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Hdhd2Q3UGR5 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Hdhd2Q3UGR5 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Hdhd2Q3UGR5 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Hdhd2Q3UGR5 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Hdhd2Q3UGR5 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Hdhd2Q3UGR5 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Hdhd2Q3UGR5 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Hdhd2Q3UGR5 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Hdhd2Q3UGR5 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Hdhd2Q3UGR5 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Hdhd2Q3UGR5 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Hdhd2Q3UGR5 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Hdhd2Q3UGR5 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Hdhd2Q3UGR5 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Hdhd2Q3UGR5 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Hdhd2Q3UGR5 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Hdhd2Q3UGR5 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
Hdhd2Q3UGR5 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Hdhd2Q3UGR5 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Hdhd2Q3UGR5 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Hdhd2Q3UGR5 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Hdhd2Q3UGR5 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Hdhd2Q3UGR5 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Hdhd2Q3UGR5 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Hdhd2Q3UGR5 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Hdhd2Q3UGR5 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Hdhd2Q3UGR5 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Hdhd2Q3UGR5 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
Hdhd2Q3UGR5 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Hdhd2Q3UGR5 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Hdhd2Q3UGR5 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Hdhd2Q3UGR5 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Hdhd2Q3UGR5 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Hdhd2Q3UGR5 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Hdhd2Q3UGR5 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Hdhd2Q3UGR5 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Hdhd2Q3UGR5 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Hdhd2Q3UGR5 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Hdhd2Q3UGR5 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Hdhd2Q3UGR5 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Hdhd2Q3UGR5 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Hdhd2Q3UGR5 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Hdhd2Q3UGR5 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Hdhd2Q3UGR5 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Hdhd2Q3UGR5 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Hdhd2Q3UGR5 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Hdhd2Q3UGR5 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
Hdhd2Q3UGR5 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Hdhd2Q3UGR5 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Hdhd2Q3UGR5 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Hdhd2Q3UGR5 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Hdhd2Q3UGR5 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Hdhd2Q3UGR5 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Hdhd2Q3UGR5 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Hdhd2Q3UGR5 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Hdhd2Q3UGR5 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Hdhd2Q3UGR5 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Hdhd2Q3UGR5 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Hdhd2Q3UGR5 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Hdhd2Q3UGR5 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Hdhd2Q3UGR5 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Hdhd2Q3UGR5 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
Hdhd2Q3UGR5 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Hdhd2Q3UGR5 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Hdhd2Q3UGR5 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Hdhd2Q3UGR5 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Hdhd2Q3UGR5 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Hdhd2Q3UGR5 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Hdhd2Q3UGR5 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Hdhd2Q3UGR5 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Hdhd2Q3UGR5 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Hdhd2Q3UGR5 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 62.1 ms