Protein–RNA interactions for Protein: Q3UFK8

Frmd8, FERM domain-containing protein 8, mousemouse

Predictions only

Length 466 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Frmd8Q3UFK8 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Frmd8Q3UFK8 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Frmd8Q3UFK8 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Frmd8Q3UFK8 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Frmd8Q3UFK8 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
Frmd8Q3UFK8 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Frmd8Q3UFK8 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Frmd8Q3UFK8 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Frmd8Q3UFK8 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Frmd8Q3UFK8 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
Frmd8Q3UFK8 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Frmd8Q3UFK8 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Frmd8Q3UFK8 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
Frmd8Q3UFK8 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Frmd8Q3UFK8 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Frmd8Q3UFK8 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Frmd8Q3UFK8 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Frmd8Q3UFK8 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Frmd8Q3UFK8 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Frmd8Q3UFK8 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
Frmd8Q3UFK8 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Frmd8Q3UFK8 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Frmd8Q3UFK8 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Frmd8Q3UFK8 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Frmd8Q3UFK8 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Frmd8Q3UFK8 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Frmd8Q3UFK8 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Frmd8Q3UFK8 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Frmd8Q3UFK8 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Frmd8Q3UFK8 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Frmd8Q3UFK8 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Frmd8Q3UFK8 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Frmd8Q3UFK8 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Frmd8Q3UFK8 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Frmd8Q3UFK8 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Frmd8Q3UFK8 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Frmd8Q3UFK8 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Frmd8Q3UFK8 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Frmd8Q3UFK8 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Frmd8Q3UFK8 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Frmd8Q3UFK8 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Frmd8Q3UFK8 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Frmd8Q3UFK8 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Frmd8Q3UFK8 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Frmd8Q3UFK8 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
Frmd8Q3UFK8 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Frmd8Q3UFK8 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Frmd8Q3UFK8 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Frmd8Q3UFK8 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Frmd8Q3UFK8 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Frmd8Q3UFK8 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Frmd8Q3UFK8 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Frmd8Q3UFK8 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Frmd8Q3UFK8 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Frmd8Q3UFK8 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Frmd8Q3UFK8 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Frmd8Q3UFK8 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Frmd8Q3UFK8 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Frmd8Q3UFK8 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
Frmd8Q3UFK8 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Frmd8Q3UFK8 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Frmd8Q3UFK8 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Frmd8Q3UFK8 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Frmd8Q3UFK8 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Frmd8Q3UFK8 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Frmd8Q3UFK8 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Frmd8Q3UFK8 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Frmd8Q3UFK8 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
Frmd8Q3UFK8 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Frmd8Q3UFK8 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Frmd8Q3UFK8 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Frmd8Q3UFK8 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Frmd8Q3UFK8 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
Frmd8Q3UFK8 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Frmd8Q3UFK8 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Frmd8Q3UFK8 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Frmd8Q3UFK8 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Frmd8Q3UFK8 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Frmd8Q3UFK8 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Frmd8Q3UFK8 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Frmd8Q3UFK8 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Frmd8Q3UFK8 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Frmd8Q3UFK8 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Frmd8Q3UFK8 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Frmd8Q3UFK8 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Frmd8Q3UFK8 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Frmd8Q3UFK8 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Frmd8Q3UFK8 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Frmd8Q3UFK8 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Frmd8Q3UFK8 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Frmd8Q3UFK8 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Frmd8Q3UFK8 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Frmd8Q3UFK8 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Frmd8Q3UFK8 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Frmd8Q3UFK8 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
Frmd8Q3UFK8 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Frmd8Q3UFK8 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Frmd8Q3UFK8 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Frmd8Q3UFK8 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Frmd8Q3UFK8 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.1 ms