Protein–RNA interactions for Protein: Q3UD01

Atxn7l3b, Ataxin-7-like protein 3B, mousemouse

Predictions only

Length 97 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atxn7l3bQ3UD01 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Atxn7l3bQ3UD01 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Atxn7l3bQ3UD01 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Atxn7l3bQ3UD01 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Atxn7l3bQ3UD01 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Atxn7l3bQ3UD01 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Atxn7l3bQ3UD01 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Atxn7l3bQ3UD01 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Atxn7l3bQ3UD01 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Atxn7l3bQ3UD01 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Atxn7l3bQ3UD01 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Atxn7l3bQ3UD01 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Atxn7l3bQ3UD01 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Atxn7l3bQ3UD01 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Atxn7l3bQ3UD01 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Atxn7l3bQ3UD01 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Atxn7l3bQ3UD01 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Atxn7l3bQ3UD01 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Atxn7l3bQ3UD01 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Atxn7l3bQ3UD01 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Atxn7l3bQ3UD01 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
Atxn7l3bQ3UD01 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Atxn7l3bQ3UD01 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Atxn7l3bQ3UD01 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Atxn7l3bQ3UD01 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Atxn7l3bQ3UD01 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Atxn7l3bQ3UD01 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Atxn7l3bQ3UD01 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Atxn7l3bQ3UD01 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Atxn7l3bQ3UD01 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Atxn7l3bQ3UD01 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
Atxn7l3bQ3UD01 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Atxn7l3bQ3UD01 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Atxn7l3bQ3UD01 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
Atxn7l3bQ3UD01 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Atxn7l3bQ3UD01 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Atxn7l3bQ3UD01 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Atxn7l3bQ3UD01 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Atxn7l3bQ3UD01 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Atxn7l3bQ3UD01 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Atxn7l3bQ3UD01 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Atxn7l3bQ3UD01 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Atxn7l3bQ3UD01 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Atxn7l3bQ3UD01 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Atxn7l3bQ3UD01 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Atxn7l3bQ3UD01 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Atxn7l3bQ3UD01 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Atxn7l3bQ3UD01 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
Atxn7l3bQ3UD01 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Atxn7l3bQ3UD01 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Atxn7l3bQ3UD01 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Atxn7l3bQ3UD01 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Atxn7l3bQ3UD01 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Atxn7l3bQ3UD01 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
Atxn7l3bQ3UD01 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Atxn7l3bQ3UD01 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Atxn7l3bQ3UD01 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Atxn7l3bQ3UD01 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Atxn7l3bQ3UD01 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
Atxn7l3bQ3UD01 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Atxn7l3bQ3UD01 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Atxn7l3bQ3UD01 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Atxn7l3bQ3UD01 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Atxn7l3bQ3UD01 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Atxn7l3bQ3UD01 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Atxn7l3bQ3UD01 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Atxn7l3bQ3UD01 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Atxn7l3bQ3UD01 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Atxn7l3bQ3UD01 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Atxn7l3bQ3UD01 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Atxn7l3bQ3UD01 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Atxn7l3bQ3UD01 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Atxn7l3bQ3UD01 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Atxn7l3bQ3UD01 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Atxn7l3bQ3UD01 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Atxn7l3bQ3UD01 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Atxn7l3bQ3UD01 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Atxn7l3bQ3UD01 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Atxn7l3bQ3UD01 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Atxn7l3bQ3UD01 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Atxn7l3bQ3UD01 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Atxn7l3bQ3UD01 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Atxn7l3bQ3UD01 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Atxn7l3bQ3UD01 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Atxn7l3bQ3UD01 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Atxn7l3bQ3UD01 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Atxn7l3bQ3UD01 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Atxn7l3bQ3UD01 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Atxn7l3bQ3UD01 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Atxn7l3bQ3UD01 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Atxn7l3bQ3UD01 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Atxn7l3bQ3UD01 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Atxn7l3bQ3UD01 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Atxn7l3bQ3UD01 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Atxn7l3bQ3UD01 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Atxn7l3bQ3UD01 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
Atxn7l3bQ3UD01 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Atxn7l3bQ3UD01 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Atxn7l3bQ3UD01 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Atxn7l3bQ3UD01 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.5 ms