Protein–RNA interactions for Protein: Q3TX51

Lrrc28, Leucine-rich repeat-containing protein 28, mousemouse

Predictions only

Length 367 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrc28Q3TX51 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Lrrc28Q3TX51 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Lrrc28Q3TX51 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Lrrc28Q3TX51 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
Lrrc28Q3TX51 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Lrrc28Q3TX51 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
Lrrc28Q3TX51 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Lrrc28Q3TX51 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Lrrc28Q3TX51 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Lrrc28Q3TX51 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Lrrc28Q3TX51 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Lrrc28Q3TX51 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
Lrrc28Q3TX51 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
Lrrc28Q3TX51 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Lrrc28Q3TX51 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Lrrc28Q3TX51 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Lrrc28Q3TX51 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Lrrc28Q3TX51 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Lrrc28Q3TX51 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Lrrc28Q3TX51 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Lrrc28Q3TX51 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Lrrc28Q3TX51 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Lrrc28Q3TX51 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Lrrc28Q3TX51 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Lrrc28Q3TX51 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Lrrc28Q3TX51 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Lrrc28Q3TX51 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Lrrc28Q3TX51 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Lrrc28Q3TX51 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Lrrc28Q3TX51 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Lrrc28Q3TX51 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Lrrc28Q3TX51 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Lrrc28Q3TX51 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Lrrc28Q3TX51 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Lrrc28Q3TX51 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Lrrc28Q3TX51 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Lrrc28Q3TX51 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Lrrc28Q3TX51 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Lrrc28Q3TX51 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Lrrc28Q3TX51 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Lrrc28Q3TX51 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Lrrc28Q3TX51 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Lrrc28Q3TX51 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Lrrc28Q3TX51 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Lrrc28Q3TX51 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Lrrc28Q3TX51 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Lrrc28Q3TX51 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Lrrc28Q3TX51 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
Lrrc28Q3TX51 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Lrrc28Q3TX51 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Lrrc28Q3TX51 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Lrrc28Q3TX51 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Lrrc28Q3TX51 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Lrrc28Q3TX51 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Lrrc28Q3TX51 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Lrrc28Q3TX51 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Lrrc28Q3TX51 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Lrrc28Q3TX51 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Lrrc28Q3TX51 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Lrrc28Q3TX51 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Lrrc28Q3TX51 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Lrrc28Q3TX51 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Lrrc28Q3TX51 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Lrrc28Q3TX51 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Lrrc28Q3TX51 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Lrrc28Q3TX51 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Lrrc28Q3TX51 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Lrrc28Q3TX51 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Lrrc28Q3TX51 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Lrrc28Q3TX51 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Lrrc28Q3TX51 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Lrrc28Q3TX51 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Lrrc28Q3TX51 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Lrrc28Q3TX51 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Lrrc28Q3TX51 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Lrrc28Q3TX51 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Lrrc28Q3TX51 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Lrrc28Q3TX51 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Lrrc28Q3TX51 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Lrrc28Q3TX51 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Lrrc28Q3TX51 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Lrrc28Q3TX51 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Lrrc28Q3TX51 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Lrrc28Q3TX51 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Lrrc28Q3TX51 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Lrrc28Q3TX51 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Lrrc28Q3TX51 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Lrrc28Q3TX51 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Lrrc28Q3TX51 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
Lrrc28Q3TX51 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
Lrrc28Q3TX51 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Lrrc28Q3TX51 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Lrrc28Q3TX51 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Lrrc28Q3TX51 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Lrrc28Q3TX51 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Lrrc28Q3TX51 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Lrrc28Q3TX51 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Lrrc28Q3TX51 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Lrrc28Q3TX51 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Lrrc28Q3TX51 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.3 ms