Protein–RNA interactions for Protein: Q3THK3

Gtf2f1, General transcription factor IIF subunit 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 508 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gtf2f1Q3THK3 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC25.94■■□□□ 1.74
Gtf2f1Q3THK3 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC25.94■■□□□ 1.74
Gtf2f1Q3THK3 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Gtf2f1Q3THK3 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Gtf2f1Q3THK3 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC25.93■■□□□ 1.74
Gtf2f1Q3THK3 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Gtf2f1Q3THK3 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Gtf2f1Q3THK3 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
Gtf2f1Q3THK3 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Gtf2f1Q3THK3 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Gtf2f1Q3THK3 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Gtf2f1Q3THK3 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Gtf2f1Q3THK3 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Gtf2f1Q3THK3 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC25.91■■□□□ 1.74
Gtf2f1Q3THK3 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Gtf2f1Q3THK3 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
Gtf2f1Q3THK3 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Gtf2f1Q3THK3 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
Gtf2f1Q3THK3 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
Gtf2f1Q3THK3 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
Gtf2f1Q3THK3 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Gtf2f1Q3THK3 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Gtf2f1Q3THK3 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Gtf2f1Q3THK3 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
Gtf2f1Q3THK3 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Gtf2f1Q3THK3 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
Gtf2f1Q3THK3 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
Gtf2f1Q3THK3 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
Gtf2f1Q3THK3 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
Gtf2f1Q3THK3 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Gtf2f1Q3THK3 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Gtf2f1Q3THK3 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Gtf2f1Q3THK3 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Gtf2f1Q3THK3 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Gtf2f1Q3THK3 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
Gtf2f1Q3THK3 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Gtf2f1Q3THK3 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Gtf2f1Q3THK3 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Gtf2f1Q3THK3 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Gtf2f1Q3THK3 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
Gtf2f1Q3THK3 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Gtf2f1Q3THK3 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Gtf2f1Q3THK3 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Gtf2f1Q3THK3 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Gtf2f1Q3THK3 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Gtf2f1Q3THK3 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Gtf2f1Q3THK3 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC25.82■■□□□ 1.72
Gtf2f1Q3THK3 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Gtf2f1Q3THK3 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Gtf2f1Q3THK3 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Gtf2f1Q3THK3 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Gtf2f1Q3THK3 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
Gtf2f1Q3THK3 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Gtf2f1Q3THK3 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
Gtf2f1Q3THK3 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Gtf2f1Q3THK3 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Gtf2f1Q3THK3 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Gtf2f1Q3THK3 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Gtf2f1Q3THK3 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Gtf2f1Q3THK3 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
Gtf2f1Q3THK3 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Gtf2f1Q3THK3 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Gtf2f1Q3THK3 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Gtf2f1Q3THK3 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Gtf2f1Q3THK3 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Gtf2f1Q3THK3 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Gtf2f1Q3THK3 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC25.77■■□□□ 1.72
Gtf2f1Q3THK3 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Gtf2f1Q3THK3 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Gtf2f1Q3THK3 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
Gtf2f1Q3THK3 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Gtf2f1Q3THK3 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
Gtf2f1Q3THK3 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
Gtf2f1Q3THK3 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Gtf2f1Q3THK3 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
Gtf2f1Q3THK3 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Gtf2f1Q3THK3 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Gtf2f1Q3THK3 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
Gtf2f1Q3THK3 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
Gtf2f1Q3THK3 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
Gtf2f1Q3THK3 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Gtf2f1Q3THK3 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Gtf2f1Q3THK3 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
Gtf2f1Q3THK3 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Gtf2f1Q3THK3 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
Gtf2f1Q3THK3 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Gtf2f1Q3THK3 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.71
Gtf2f1Q3THK3 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Gtf2f1Q3THK3 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Gtf2f1Q3THK3 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Gtf2f1Q3THK3 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Gtf2f1Q3THK3 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Gtf2f1Q3THK3 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
Gtf2f1Q3THK3 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Gtf2f1Q3THK3 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Gtf2f1Q3THK3 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC25.68■■□□□ 1.7
Gtf2f1Q3THK3 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Gtf2f1Q3THK3 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
Gtf2f1Q3THK3 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Gtf2f1Q3THK3 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.8 ms