Protein–RNA interactions for Protein: Q3TCH7

Cul4a, Cullin-4A, mousemouse

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Length 759 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cul4aQ3TCH7 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
Cul4aQ3TCH7 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Cul4aQ3TCH7 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Cul4aQ3TCH7 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Cul4aQ3TCH7 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Cul4aQ3TCH7 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Cul4aQ3TCH7 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Cul4aQ3TCH7 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Cul4aQ3TCH7 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Cul4aQ3TCH7 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
Cul4aQ3TCH7 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Cul4aQ3TCH7 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Cul4aQ3TCH7 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Cul4aQ3TCH7 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Cul4aQ3TCH7 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Cul4aQ3TCH7 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Cul4aQ3TCH7 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Cul4aQ3TCH7 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Cul4aQ3TCH7 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Cul4aQ3TCH7 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Cul4aQ3TCH7 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Cul4aQ3TCH7 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
Cul4aQ3TCH7 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Cul4aQ3TCH7 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Cul4aQ3TCH7 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Cul4aQ3TCH7 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Cul4aQ3TCH7 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Cul4aQ3TCH7 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Cul4aQ3TCH7 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Cul4aQ3TCH7 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Cul4aQ3TCH7 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Cul4aQ3TCH7 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Cul4aQ3TCH7 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Cul4aQ3TCH7 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Cul4aQ3TCH7 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Cul4aQ3TCH7 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Cul4aQ3TCH7 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Cul4aQ3TCH7 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Cul4aQ3TCH7 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Cul4aQ3TCH7 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Cul4aQ3TCH7 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Cul4aQ3TCH7 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Cul4aQ3TCH7 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Cul4aQ3TCH7 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Cul4aQ3TCH7 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Cul4aQ3TCH7 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Cul4aQ3TCH7 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Cul4aQ3TCH7 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Cul4aQ3TCH7 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Cul4aQ3TCH7 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Cul4aQ3TCH7 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Cul4aQ3TCH7 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Cul4aQ3TCH7 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Cul4aQ3TCH7 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Cul4aQ3TCH7 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Cul4aQ3TCH7 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Cul4aQ3TCH7 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Cul4aQ3TCH7 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Cul4aQ3TCH7 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Cul4aQ3TCH7 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Cul4aQ3TCH7 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Cul4aQ3TCH7 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Cul4aQ3TCH7 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Cul4aQ3TCH7 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Cul4aQ3TCH7 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Cul4aQ3TCH7 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Cul4aQ3TCH7 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
Cul4aQ3TCH7 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Cul4aQ3TCH7 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Cul4aQ3TCH7 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Cul4aQ3TCH7 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Cul4aQ3TCH7 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Cul4aQ3TCH7 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Cul4aQ3TCH7 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Cul4aQ3TCH7 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Cul4aQ3TCH7 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Cul4aQ3TCH7 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Cul4aQ3TCH7 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Cul4aQ3TCH7 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Cul4aQ3TCH7 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Cul4aQ3TCH7 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Cul4aQ3TCH7 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Cul4aQ3TCH7 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Cul4aQ3TCH7 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Cul4aQ3TCH7 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Cul4aQ3TCH7 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Cul4aQ3TCH7 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Cul4aQ3TCH7 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Cul4aQ3TCH7 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Cul4aQ3TCH7 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Cul4aQ3TCH7 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Cul4aQ3TCH7 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Cul4aQ3TCH7 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Cul4aQ3TCH7 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Cul4aQ3TCH7 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Cul4aQ3TCH7 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Cul4aQ3TCH7 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Cul4aQ3TCH7 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Cul4aQ3TCH7 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Cul4aQ3TCH7 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
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