Protein–RNA interactions for Protein: Q1ERP8

Cd300lg, CMRF35-like molecule 9, mousemouse

Predictions only

Length 331 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cd300lgQ1ERP8 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Cd300lgQ1ERP8 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
Cd300lgQ1ERP8 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Cd300lgQ1ERP8 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Cd300lgQ1ERP8 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Cd300lgQ1ERP8 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Cd300lgQ1ERP8 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Cd300lgQ1ERP8 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Cd300lgQ1ERP8 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Cd300lgQ1ERP8 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Cd300lgQ1ERP8 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Cd300lgQ1ERP8 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Cd300lgQ1ERP8 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Cd300lgQ1ERP8 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Cd300lgQ1ERP8 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Cd300lgQ1ERP8 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Cd300lgQ1ERP8 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Cd300lgQ1ERP8 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Cd300lgQ1ERP8 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Cd300lgQ1ERP8 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Cd300lgQ1ERP8 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Cd300lgQ1ERP8 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Cd300lgQ1ERP8 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Cd300lgQ1ERP8 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
Cd300lgQ1ERP8 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Cd300lgQ1ERP8 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Cd300lgQ1ERP8 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Cd300lgQ1ERP8 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Cd300lgQ1ERP8 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Cd300lgQ1ERP8 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
Cd300lgQ1ERP8 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Cd300lgQ1ERP8 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Cd300lgQ1ERP8 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Cd300lgQ1ERP8 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Cd300lgQ1ERP8 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Cd300lgQ1ERP8 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Cd300lgQ1ERP8 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
Cd300lgQ1ERP8 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Cd300lgQ1ERP8 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Cd300lgQ1ERP8 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Cd300lgQ1ERP8 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Cd300lgQ1ERP8 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Cd300lgQ1ERP8 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Cd300lgQ1ERP8 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Cd300lgQ1ERP8 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Cd300lgQ1ERP8 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
Cd300lgQ1ERP8 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Cd300lgQ1ERP8 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Cd300lgQ1ERP8 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Cd300lgQ1ERP8 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Cd300lgQ1ERP8 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Cd300lgQ1ERP8 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Cd300lgQ1ERP8 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Cd300lgQ1ERP8 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Cd300lgQ1ERP8 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Cd300lgQ1ERP8 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Cd300lgQ1ERP8 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Cd300lgQ1ERP8 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Cd300lgQ1ERP8 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Cd300lgQ1ERP8 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Cd300lgQ1ERP8 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Cd300lgQ1ERP8 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
Cd300lgQ1ERP8 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Cd300lgQ1ERP8 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Cd300lgQ1ERP8 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Cd300lgQ1ERP8 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Cd300lgQ1ERP8 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Cd300lgQ1ERP8 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Cd300lgQ1ERP8 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Cd300lgQ1ERP8 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Cd300lgQ1ERP8 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
Cd300lgQ1ERP8 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Cd300lgQ1ERP8 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Cd300lgQ1ERP8 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Cd300lgQ1ERP8 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Cd300lgQ1ERP8 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
Cd300lgQ1ERP8 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Cd300lgQ1ERP8 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Cd300lgQ1ERP8 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Cd300lgQ1ERP8 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Cd300lgQ1ERP8 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Cd300lgQ1ERP8 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Cd300lgQ1ERP8 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Cd300lgQ1ERP8 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Cd300lgQ1ERP8 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Cd300lgQ1ERP8 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Cd300lgQ1ERP8 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Cd300lgQ1ERP8 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Cd300lgQ1ERP8 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Cd300lgQ1ERP8 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
Cd300lgQ1ERP8 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Cd300lgQ1ERP8 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Cd300lgQ1ERP8 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Cd300lgQ1ERP8 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Cd300lgQ1ERP8 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Cd300lgQ1ERP8 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Cd300lgQ1ERP8 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Cd300lgQ1ERP8 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Cd300lgQ1ERP8 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Cd300lgQ1ERP8 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.7 ms