Protein–RNA interactions for Protein: Q0VF55

Atp2b3, Calcium-transporting ATPase, mousemouse

Predictions only

Length 1,220 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp2b3Q0VF55 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Atp2b3Q0VF55 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Atp2b3Q0VF55 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Atp2b3Q0VF55 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Atp2b3Q0VF55 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Atp2b3Q0VF55 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Atp2b3Q0VF55 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Atp2b3Q0VF55 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Atp2b3Q0VF55 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC27.78■■■□□ 2.04
Atp2b3Q0VF55 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Atp2b3Q0VF55 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC27.78■■■□□ 2.04
Atp2b3Q0VF55 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC27.77■■■□□ 2.04
Atp2b3Q0VF55 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Atp2b3Q0VF55 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Atp2b3Q0VF55 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
Atp2b3Q0VF55 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Atp2b3Q0VF55 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Atp2b3Q0VF55 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Atp2b3Q0VF55 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Atp2b3Q0VF55 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
Atp2b3Q0VF55 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Atp2b3Q0VF55 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Atp2b3Q0VF55 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC27.73■■■□□ 2.03
Atp2b3Q0VF55 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Atp2b3Q0VF55 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Atp2b3Q0VF55 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Atp2b3Q0VF55 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
Atp2b3Q0VF55 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
Atp2b3Q0VF55 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Atp2b3Q0VF55 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
Atp2b3Q0VF55 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Atp2b3Q0VF55 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Atp2b3Q0VF55 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Atp2b3Q0VF55 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Atp2b3Q0VF55 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC27.7■■■□□ 2.03
Atp2b3Q0VF55 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.02
Atp2b3Q0VF55 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
Atp2b3Q0VF55 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
Atp2b3Q0VF55 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
Atp2b3Q0VF55 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Atp2b3Q0VF55 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Atp2b3Q0VF55 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
Atp2b3Q0VF55 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Atp2b3Q0VF55 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC27.68■■■□□ 2.02
Atp2b3Q0VF55 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC27.68■■■□□ 2.02
Atp2b3Q0VF55 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Atp2b3Q0VF55 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Atp2b3Q0VF55 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Atp2b3Q0VF55 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Atp2b3Q0VF55 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Atp2b3Q0VF55 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Atp2b3Q0VF55 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Atp2b3Q0VF55 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Atp2b3Q0VF55 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Atp2b3Q0VF55 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
Atp2b3Q0VF55 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Atp2b3Q0VF55 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
Atp2b3Q0VF55 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Atp2b3Q0VF55 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Atp2b3Q0VF55 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Atp2b3Q0VF55 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Atp2b3Q0VF55 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
Atp2b3Q0VF55 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC27.64■■■□□ 2.02
Atp2b3Q0VF55 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
Atp2b3Q0VF55 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
Atp2b3Q0VF55 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
Atp2b3Q0VF55 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Atp2b3Q0VF55 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Atp2b3Q0VF55 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
Atp2b3Q0VF55 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
Atp2b3Q0VF55 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC27.62■■■□□ 2.01
Atp2b3Q0VF55 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Atp2b3Q0VF55 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Atp2b3Q0VF55 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
Atp2b3Q0VF55 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Atp2b3Q0VF55 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
Atp2b3Q0VF55 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Atp2b3Q0VF55 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Atp2b3Q0VF55 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Atp2b3Q0VF55 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
Atp2b3Q0VF55 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Atp2b3Q0VF55 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Atp2b3Q0VF55 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Atp2b3Q0VF55 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
Atp2b3Q0VF55 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Atp2b3Q0VF55 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Atp2b3Q0VF55 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
Atp2b3Q0VF55 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Atp2b3Q0VF55 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2
Atp2b3Q0VF55 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Atp2b3Q0VF55 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Atp2b3Q0VF55 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
Atp2b3Q0VF55 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Atp2b3Q0VF55 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Atp2b3Q0VF55 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Atp2b3Q0VF55 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
Atp2b3Q0VF55 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
Atp2b3Q0VF55 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Atp2b3Q0VF55 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
Atp2b3Q0VF55 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC27.54■■■□□ 2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 69 ms