Protein–RNA interactions for Protein: Q0P678

Zc3h18, Zinc finger CCCH domain-containing protein 18, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 948 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zc3h18Q0P678 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Zc3h18Q0P678 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Zc3h18Q0P678 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Zc3h18Q0P678 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Zc3h18Q0P678 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Zc3h18Q0P678 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
Zc3h18Q0P678 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Zc3h18Q0P678 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Zc3h18Q0P678 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Zc3h18Q0P678 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Zc3h18Q0P678 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Zc3h18Q0P678 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
Zc3h18Q0P678 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Zc3h18Q0P678 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Zc3h18Q0P678 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Zc3h18Q0P678 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Zc3h18Q0P678 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Zc3h18Q0P678 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Zc3h18Q0P678 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Zc3h18Q0P678 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Zc3h18Q0P678 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Zc3h18Q0P678 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Zc3h18Q0P678 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
Zc3h18Q0P678 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Zc3h18Q0P678 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Zc3h18Q0P678 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
Zc3h18Q0P678 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Zc3h18Q0P678 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Zc3h18Q0P678 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Zc3h18Q0P678 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Zc3h18Q0P678 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Zc3h18Q0P678 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Zc3h18Q0P678 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Zc3h18Q0P678 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Zc3h18Q0P678 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Zc3h18Q0P678 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Zc3h18Q0P678 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Zc3h18Q0P678 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Zc3h18Q0P678 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Zc3h18Q0P678 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Zc3h18Q0P678 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Zc3h18Q0P678 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Zc3h18Q0P678 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Zc3h18Q0P678 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Zc3h18Q0P678 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
Zc3h18Q0P678 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
Zc3h18Q0P678 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Zc3h18Q0P678 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Zc3h18Q0P678 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Zc3h18Q0P678 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Zc3h18Q0P678 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Zc3h18Q0P678 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
Zc3h18Q0P678 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
Zc3h18Q0P678 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Zc3h18Q0P678 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Zc3h18Q0P678 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC24.64■■□□□ 1.54
Zc3h18Q0P678 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
Zc3h18Q0P678 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
Zc3h18Q0P678 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Zc3h18Q0P678 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Zc3h18Q0P678 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Zc3h18Q0P678 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Zc3h18Q0P678 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
Zc3h18Q0P678 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Zc3h18Q0P678 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Zc3h18Q0P678 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Zc3h18Q0P678 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Zc3h18Q0P678 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Zc3h18Q0P678 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Zc3h18Q0P678 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Zc3h18Q0P678 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Zc3h18Q0P678 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
Zc3h18Q0P678 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Zc3h18Q0P678 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Zc3h18Q0P678 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Zc3h18Q0P678 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Zc3h18Q0P678 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Zc3h18Q0P678 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Zc3h18Q0P678 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Zc3h18Q0P678 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Zc3h18Q0P678 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Zc3h18Q0P678 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Zc3h18Q0P678 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Zc3h18Q0P678 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Zc3h18Q0P678 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Zc3h18Q0P678 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Zc3h18Q0P678 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Zc3h18Q0P678 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
Zc3h18Q0P678 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Zc3h18Q0P678 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Zc3h18Q0P678 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Zc3h18Q0P678 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Zc3h18Q0P678 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Zc3h18Q0P678 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Zc3h18Q0P678 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Zc3h18Q0P678 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Zc3h18Q0P678 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Zc3h18Q0P678 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Zc3h18Q0P678 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Zc3h18Q0P678 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16 ms