Protein–RNA interactions for Protein: Q0P5X1

Lrriq1, Leucine-rich repeat and IQ domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,673 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrriq1Q0P5X1 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC38.72■■■■□ 3.79
Lrriq1Q0P5X1 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC38.71■■■■□ 3.79
Lrriq1Q0P5X1 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC38.71■■■■□ 3.79
Lrriq1Q0P5X1 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC38.71■■■■□ 3.79
Lrriq1Q0P5X1 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.7■■■■□ 3.79
Lrriq1Q0P5X1 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC38.69■■■■□ 3.78
Lrriq1Q0P5X1 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC38.68■■■■□ 3.78
Lrriq1Q0P5X1 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC38.68■■■■□ 3.78
Lrriq1Q0P5X1 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.68■■■■□ 3.78
Lrriq1Q0P5X1 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.67■■■■□ 3.78
Lrriq1Q0P5X1 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.66■■■■□ 3.78
Lrriq1Q0P5X1 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC38.66■■■■□ 3.78
Lrriq1Q0P5X1 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.66■■■■□ 3.78
Lrriq1Q0P5X1 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC38.66■■■■□ 3.78
Lrriq1Q0P5X1 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC38.65■■■■□ 3.78
Lrriq1Q0P5X1 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.64■■■■□ 3.78
Lrriq1Q0P5X1 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC38.64■■■■□ 3.78
Lrriq1Q0P5X1 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.64■■■■□ 3.78
Lrriq1Q0P5X1 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC38.64■■■■□ 3.78
Lrriq1Q0P5X1 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.64■■■■□ 3.78
Lrriq1Q0P5X1 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.63■■■■□ 3.78
Lrriq1Q0P5X1 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC38.62■■■■□ 3.77
Lrriq1Q0P5X1 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.62■■■■□ 3.77
Lrriq1Q0P5X1 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC38.62■■■■□ 3.77
Lrriq1Q0P5X1 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC38.62■■■■□ 3.77
Lrriq1Q0P5X1 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC38.62■■■■□ 3.77
Lrriq1Q0P5X1 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC38.62■■■■□ 3.77
Lrriq1Q0P5X1 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC38.62■■■■□ 3.77
Lrriq1Q0P5X1 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC38.61■■■■□ 3.77
Lrriq1Q0P5X1 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC38.61■■■■□ 3.77
Lrriq1Q0P5X1 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC38.61■■■■□ 3.77
Lrriq1Q0P5X1 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.6■■■■□ 3.77
Lrriq1Q0P5X1 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC38.6■■■■□ 3.77
Lrriq1Q0P5X1 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC38.58■■■■□ 3.77
Lrriq1Q0P5X1 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.58■■■■□ 3.77
Lrriq1Q0P5X1 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC38.57■■■■□ 3.77
Lrriq1Q0P5X1 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC38.56■■■■□ 3.76
Lrriq1Q0P5X1 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.56■■■■□ 3.76
Lrriq1Q0P5X1 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.55■■■■□ 3.76
Lrriq1Q0P5X1 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.55■■■■□ 3.76
Lrriq1Q0P5X1 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC38.54■■■■□ 3.76
Lrriq1Q0P5X1 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC38.53■■■■□ 3.76
Lrriq1Q0P5X1 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC38.53■■■■□ 3.76
Lrriq1Q0P5X1 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC38.52■■■■□ 3.76
Lrriq1Q0P5X1 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC38.52■■■■□ 3.76
Lrriq1Q0P5X1 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC38.52■■■■□ 3.76
Lrriq1Q0P5X1 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC38.5■■■■□ 3.75
Lrriq1Q0P5X1 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.5■■■■□ 3.75
Lrriq1Q0P5X1 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.49■■■■□ 3.75
Lrriq1Q0P5X1 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC38.49■■■■□ 3.75
Lrriq1Q0P5X1 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC38.46■■■■□ 3.75
Lrriq1Q0P5X1 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.46■■■■□ 3.75
Lrriq1Q0P5X1 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC38.46■■■■□ 3.75
Lrriq1Q0P5X1 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC38.45■■■■□ 3.75
Lrriq1Q0P5X1 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.45■■■■□ 3.75
Lrriq1Q0P5X1 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC38.45■■■■□ 3.75
Lrriq1Q0P5X1 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.44■■■■□ 3.74
Lrriq1Q0P5X1 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.44■■■■□ 3.74
Lrriq1Q0P5X1 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC38.43■■■■□ 3.74
Lrriq1Q0P5X1 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC38.43■■■■□ 3.74
Lrriq1Q0P5X1 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.43■■■■□ 3.74
Lrriq1Q0P5X1 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC38.43■■■■□ 3.74
Lrriq1Q0P5X1 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.42■■■■□ 3.74
Lrriq1Q0P5X1 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.42■■■■□ 3.74
Lrriq1Q0P5X1 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC38.42■■■■□ 3.74
Lrriq1Q0P5X1 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC38.39■■■■□ 3.74
Lrriq1Q0P5X1 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC38.39■■■■□ 3.74
Lrriq1Q0P5X1 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC38.38■■■■□ 3.73
Lrriq1Q0P5X1 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC38.37■■■■□ 3.73
Lrriq1Q0P5X1 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC38.36■■■■□ 3.73
Lrriq1Q0P5X1 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC38.36■■■■□ 3.73
Lrriq1Q0P5X1 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC38.36■■■■□ 3.73
Lrriq1Q0P5X1 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC38.35■■■■□ 3.73
Lrriq1Q0P5X1 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC38.35■■■■□ 3.73
Lrriq1Q0P5X1 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC38.34■■■■□ 3.73
Lrriq1Q0P5X1 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.34■■■■□ 3.73
Lrriq1Q0P5X1 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC38.33■■■■□ 3.73
Lrriq1Q0P5X1 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC38.33■■■■□ 3.73
Lrriq1Q0P5X1 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.33■■■■□ 3.73
Lrriq1Q0P5X1 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC38.33■■■■□ 3.73
Lrriq1Q0P5X1 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.32■■■■□ 3.73
Lrriq1Q0P5X1 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC38.32■■■■□ 3.72
Lrriq1Q0P5X1 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.31■■■■□ 3.72
Lrriq1Q0P5X1 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.31■■■■□ 3.72
Lrriq1Q0P5X1 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.3■■■■□ 3.72
Lrriq1Q0P5X1 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC38.29■■■■□ 3.72
Lrriq1Q0P5X1 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC38.29■■■■□ 3.72
Lrriq1Q0P5X1 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC38.28■■■■□ 3.72
Lrriq1Q0P5X1 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.28■■■■□ 3.72
Lrriq1Q0P5X1 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.27■■■■□ 3.72
Lrriq1Q0P5X1 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC38.27■■■■□ 3.72
Lrriq1Q0P5X1 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC38.27■■■■□ 3.72
Lrriq1Q0P5X1 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.27■■■■□ 3.72
Lrriq1Q0P5X1 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC38.26■■■■□ 3.71
Lrriq1Q0P5X1 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC38.26■■■■□ 3.71
Lrriq1Q0P5X1 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC38.26■■■■□ 3.71
Lrriq1Q0P5X1 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC38.25■■■■□ 3.71
Lrriq1Q0P5X1 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC38.25■■■■□ 3.71
Lrriq1Q0P5X1 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC38.24■■■■□ 3.71
Lrriq1Q0P5X1 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC38.24■■■■□ 3.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 70.4 ms