Protein–RNA interactions for Protein: Q0II04

Nebl, Nebulette, mousemouse

Predictions only

Length 452 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NeblQ0II04 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
NeblQ0II04 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
NeblQ0II04 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
NeblQ0II04 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
NeblQ0II04 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
NeblQ0II04 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
NeblQ0II04 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
NeblQ0II04 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
NeblQ0II04 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
NeblQ0II04 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
NeblQ0II04 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
NeblQ0II04 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC24.24■■□□□ 1.47
NeblQ0II04 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
NeblQ0II04 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
NeblQ0II04 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
NeblQ0II04 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
NeblQ0II04 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
NeblQ0II04 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
NeblQ0II04 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
NeblQ0II04 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
NeblQ0II04 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
NeblQ0II04 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
NeblQ0II04 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
NeblQ0II04 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
NeblQ0II04 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
NeblQ0II04 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.47
NeblQ0II04 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
NeblQ0II04 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
NeblQ0II04 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
NeblQ0II04 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
NeblQ0II04 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
NeblQ0II04 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
NeblQ0II04 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
NeblQ0II04 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
NeblQ0II04 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
NeblQ0II04 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
NeblQ0II04 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
NeblQ0II04 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
NeblQ0II04 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
NeblQ0II04 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
NeblQ0II04 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
NeblQ0II04 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
NeblQ0II04 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
NeblQ0II04 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
NeblQ0II04 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
NeblQ0II04 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
NeblQ0II04 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
NeblQ0II04 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC24.17■■□□□ 1.46
NeblQ0II04 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
NeblQ0II04 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
NeblQ0II04 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
NeblQ0II04 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
NeblQ0II04 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
NeblQ0II04 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
NeblQ0II04 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
NeblQ0II04 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
NeblQ0II04 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
NeblQ0II04 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
NeblQ0II04 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
NeblQ0II04 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
NeblQ0II04 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
NeblQ0II04 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
NeblQ0II04 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
NeblQ0II04 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
NeblQ0II04 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
NeblQ0II04 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC24.14■■□□□ 1.45
NeblQ0II04 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
NeblQ0II04 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
NeblQ0II04 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
NeblQ0II04 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
NeblQ0II04 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
NeblQ0II04 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
NeblQ0II04 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
NeblQ0II04 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
NeblQ0II04 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
NeblQ0II04 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
NeblQ0II04 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
NeblQ0II04 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
NeblQ0II04 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
NeblQ0II04 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
NeblQ0II04 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
NeblQ0II04 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
NeblQ0II04 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
NeblQ0II04 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
NeblQ0II04 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
NeblQ0II04 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
NeblQ0II04 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
NeblQ0II04 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
NeblQ0II04 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
NeblQ0II04 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
NeblQ0II04 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
NeblQ0II04 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
NeblQ0II04 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
NeblQ0II04 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
NeblQ0II04 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
NeblQ0II04 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC24.06■■□□□ 1.44
NeblQ0II04 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
NeblQ0II04 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
NeblQ0II04 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
NeblQ0II04 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.2 ms