Protein–RNA interactions for Protein: Q05A06

Vmn1r236, Vomeronasal type-1 receptor, mousemouse

Predictions only

Length 334 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn1r236Q05A06 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Vmn1r236Q05A06 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.69
Vmn1r236Q05A06 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Vmn1r236Q05A06 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Vmn1r236Q05A06 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Vmn1r236Q05A06 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Vmn1r236Q05A06 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Vmn1r236Q05A06 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Vmn1r236Q05A06 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Vmn1r236Q05A06 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Vmn1r236Q05A06 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Vmn1r236Q05A06 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Vmn1r236Q05A06 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Vmn1r236Q05A06 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Vmn1r236Q05A06 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Vmn1r236Q05A06 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Vmn1r236Q05A06 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Vmn1r236Q05A06 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Vmn1r236Q05A06 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Vmn1r236Q05A06 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Vmn1r236Q05A06 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Vmn1r236Q05A06 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Vmn1r236Q05A06 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Vmn1r236Q05A06 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Vmn1r236Q05A06 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Vmn1r236Q05A06 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Vmn1r236Q05A06 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Vmn1r236Q05A06 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Vmn1r236Q05A06 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Vmn1r236Q05A06 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Vmn1r236Q05A06 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Vmn1r236Q05A06 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Vmn1r236Q05A06 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Vmn1r236Q05A06 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Vmn1r236Q05A06 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Vmn1r236Q05A06 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Vmn1r236Q05A06 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Vmn1r236Q05A06 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Vmn1r236Q05A06 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Vmn1r236Q05A06 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Vmn1r236Q05A06 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Vmn1r236Q05A06 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Vmn1r236Q05A06 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Vmn1r236Q05A06 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Vmn1r236Q05A06 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Vmn1r236Q05A06 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Vmn1r236Q05A06 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Vmn1r236Q05A06 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
Vmn1r236Q05A06 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Vmn1r236Q05A06 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Vmn1r236Q05A06 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Vmn1r236Q05A06 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
Vmn1r236Q05A06 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Vmn1r236Q05A06 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Vmn1r236Q05A06 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
Vmn1r236Q05A06 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Vmn1r236Q05A06 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Vmn1r236Q05A06 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Vmn1r236Q05A06 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Vmn1r236Q05A06 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
Vmn1r236Q05A06 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Vmn1r236Q05A06 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Vmn1r236Q05A06 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Vmn1r236Q05A06 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Vmn1r236Q05A06 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Vmn1r236Q05A06 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Vmn1r236Q05A06 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Vmn1r236Q05A06 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Vmn1r236Q05A06 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Vmn1r236Q05A06 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Vmn1r236Q05A06 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Vmn1r236Q05A06 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Vmn1r236Q05A06 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Vmn1r236Q05A06 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Vmn1r236Q05A06 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Vmn1r236Q05A06 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Vmn1r236Q05A06 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Vmn1r236Q05A06 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Vmn1r236Q05A06 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Vmn1r236Q05A06 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Vmn1r236Q05A06 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Vmn1r236Q05A06 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Vmn1r236Q05A06 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Vmn1r236Q05A06 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Vmn1r236Q05A06 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Vmn1r236Q05A06 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Vmn1r236Q05A06 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Vmn1r236Q05A06 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Vmn1r236Q05A06 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Vmn1r236Q05A06 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
Vmn1r236Q05A06 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Vmn1r236Q05A06 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Vmn1r236Q05A06 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Vmn1r236Q05A06 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
Vmn1r236Q05A06 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Vmn1r236Q05A06 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Vmn1r236Q05A06 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Vmn1r236Q05A06 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Vmn1r236Q05A06 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Vmn1r236Q05A06 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.3 ms