Protein–RNA interactions for Protein: Q05793

Hspg2, Basement membrane-specific heparan sulfate proteoglycan core protein, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 3,707 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hspg2Q05793 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Hspg2Q05793 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Hspg2Q05793 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Hspg2Q05793 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Hspg2Q05793 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Hspg2Q05793 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Hspg2Q05793 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Hspg2Q05793 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Hspg2Q05793 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Hspg2Q05793 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Hspg2Q05793 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Hspg2Q05793 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Hspg2Q05793 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Hspg2Q05793 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
Hspg2Q05793 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Hspg2Q05793 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Hspg2Q05793 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Hspg2Q05793 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Hspg2Q05793 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Hspg2Q05793 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Hspg2Q05793 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Hspg2Q05793 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Hspg2Q05793 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
Hspg2Q05793 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Hspg2Q05793 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Hspg2Q05793 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Hspg2Q05793 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Hspg2Q05793 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Hspg2Q05793 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Hspg2Q05793 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Hspg2Q05793 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Hspg2Q05793 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Hspg2Q05793 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Hspg2Q05793 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Hspg2Q05793 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Hspg2Q05793 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Hspg2Q05793 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Hspg2Q05793 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Hspg2Q05793 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Hspg2Q05793 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Hspg2Q05793 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Hspg2Q05793 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Hspg2Q05793 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Hspg2Q05793 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Hspg2Q05793 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Hspg2Q05793 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
Hspg2Q05793 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Hspg2Q05793 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Hspg2Q05793 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Hspg2Q05793 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Hspg2Q05793 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Hspg2Q05793 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Hspg2Q05793 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Hspg2Q05793 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Hspg2Q05793 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Hspg2Q05793 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Hspg2Q05793 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Hspg2Q05793 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Hspg2Q05793 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Hspg2Q05793 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Hspg2Q05793 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Hspg2Q05793 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Hspg2Q05793 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Hspg2Q05793 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Hspg2Q05793 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Hspg2Q05793 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Hspg2Q05793 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Hspg2Q05793 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Hspg2Q05793 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Hspg2Q05793 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Hspg2Q05793 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Hspg2Q05793 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Hspg2Q05793 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Hspg2Q05793 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Hspg2Q05793 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Hspg2Q05793 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Hspg2Q05793 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Hspg2Q05793 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Hspg2Q05793 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Hspg2Q05793 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Hspg2Q05793 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Hspg2Q05793 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Hspg2Q05793 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Hspg2Q05793 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Hspg2Q05793 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Hspg2Q05793 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Hspg2Q05793 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
Hspg2Q05793 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Hspg2Q05793 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Hspg2Q05793 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Hspg2Q05793 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Hspg2Q05793 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Hspg2Q05793 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Hspg2Q05793 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Hspg2Q05793 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Hspg2Q05793 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Hspg2Q05793 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Hspg2Q05793 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Hspg2Q05793 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Hspg2Q05793 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.2 ms