Protein–RNA interactions for Protein: Q03366

Ccl7, C-C motif chemokine 7, mousemouse

Predictions only

Length 97 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccl7Q03366 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Ccl7Q03366 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Ccl7Q03366 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Ccl7Q03366 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Ccl7Q03366 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Ccl7Q03366 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Ccl7Q03366 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Ccl7Q03366 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
Ccl7Q03366 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Ccl7Q03366 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Ccl7Q03366 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
Ccl7Q03366 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC19.08■□□□□ 0.65
Ccl7Q03366 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Ccl7Q03366 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Ccl7Q03366 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Ccl7Q03366 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Ccl7Q03366 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Ccl7Q03366 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Ccl7Q03366 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Ccl7Q03366 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
Ccl7Q03366 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Ccl7Q03366 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Ccl7Q03366 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Ccl7Q03366 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Ccl7Q03366 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Ccl7Q03366 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Ccl7Q03366 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Ccl7Q03366 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Ccl7Q03366 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
Ccl7Q03366 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
Ccl7Q03366 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Ccl7Q03366 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Ccl7Q03366 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Ccl7Q03366 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Ccl7Q03366 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Ccl7Q03366 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Ccl7Q03366 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Ccl7Q03366 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Ccl7Q03366 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Ccl7Q03366 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Ccl7Q03366 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Ccl7Q03366 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Ccl7Q03366 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Ccl7Q03366 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Ccl7Q03366 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Ccl7Q03366 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Ccl7Q03366 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Ccl7Q03366 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Ccl7Q03366 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC19■□□□□ 0.63
Ccl7Q03366 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Ccl7Q03366 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Ccl7Q03366 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Ccl7Q03366 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Ccl7Q03366 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Ccl7Q03366 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Ccl7Q03366 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Ccl7Q03366 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Ccl7Q03366 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Ccl7Q03366 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
Ccl7Q03366 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Ccl7Q03366 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Ccl7Q03366 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Ccl7Q03366 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Ccl7Q03366 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Ccl7Q03366 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Ccl7Q03366 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Ccl7Q03366 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Ccl7Q03366 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Ccl7Q03366 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Ccl7Q03366 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
Ccl7Q03366 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Ccl7Q03366 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Ccl7Q03366 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Ccl7Q03366 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
Ccl7Q03366 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Ccl7Q03366 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Ccl7Q03366 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Ccl7Q03366 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Ccl7Q03366 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Ccl7Q03366 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Ccl7Q03366 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Ccl7Q03366 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Ccl7Q03366 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Ccl7Q03366 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Ccl7Q03366 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Ccl7Q03366 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Ccl7Q03366 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Ccl7Q03366 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
Ccl7Q03366 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Ccl7Q03366 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
Ccl7Q03366 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Ccl7Q03366 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Ccl7Q03366 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Ccl7Q03366 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Ccl7Q03366 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
Ccl7Q03366 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Ccl7Q03366 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Ccl7Q03366 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Ccl7Q03366 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Ccl7Q03366 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26 ms