Protein–RNA interactions for Protein: Q03172

Hivep1, Zinc finger protein 40, mousemouse

Predictions only

Length 2,688 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hivep1Q03172 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Hivep1Q03172 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Hivep1Q03172 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Hivep1Q03172 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Hivep1Q03172 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Hivep1Q03172 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Hivep1Q03172 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Hivep1Q03172 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Hivep1Q03172 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Hivep1Q03172 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Hivep1Q03172 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Hivep1Q03172 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Hivep1Q03172 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Hivep1Q03172 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Hivep1Q03172 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Hivep1Q03172 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Hivep1Q03172 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Hivep1Q03172 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Hivep1Q03172 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Hivep1Q03172 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Hivep1Q03172 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Hivep1Q03172 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Hivep1Q03172 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Hivep1Q03172 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Hivep1Q03172 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Hivep1Q03172 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Hivep1Q03172 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Hivep1Q03172 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Hivep1Q03172 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Hivep1Q03172 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Hivep1Q03172 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Hivep1Q03172 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Hivep1Q03172 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Hivep1Q03172 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Hivep1Q03172 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Hivep1Q03172 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Hivep1Q03172 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Hivep1Q03172 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Hivep1Q03172 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Hivep1Q03172 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Hivep1Q03172 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Hivep1Q03172 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Hivep1Q03172 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Hivep1Q03172 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Hivep1Q03172 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Hivep1Q03172 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Hivep1Q03172 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Hivep1Q03172 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Hivep1Q03172 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Hivep1Q03172 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Hivep1Q03172 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Hivep1Q03172 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Hivep1Q03172 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Hivep1Q03172 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Hivep1Q03172 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Hivep1Q03172 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC18.02■□□□□ 0.47
Hivep1Q03172 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Hivep1Q03172 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Hivep1Q03172 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Hivep1Q03172 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Hivep1Q03172 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Hivep1Q03172 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
Hivep1Q03172 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Hivep1Q03172 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Hivep1Q03172 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Hivep1Q03172 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Hivep1Q03172 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Hivep1Q03172 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Hivep1Q03172 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Hivep1Q03172 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Hivep1Q03172 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Hivep1Q03172 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Hivep1Q03172 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Hivep1Q03172 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Hivep1Q03172 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Hivep1Q03172 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Hivep1Q03172 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Hivep1Q03172 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Hivep1Q03172 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Hivep1Q03172 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Hivep1Q03172 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Hivep1Q03172 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Hivep1Q03172 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Hivep1Q03172 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Hivep1Q03172 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Hivep1Q03172 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Hivep1Q03172 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Hivep1Q03172 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Hivep1Q03172 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Hivep1Q03172 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Hivep1Q03172 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Hivep1Q03172 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Hivep1Q03172 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Hivep1Q03172 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Hivep1Q03172 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Hivep1Q03172 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Hivep1Q03172 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Hivep1Q03172 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Hivep1Q03172 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Hivep1Q03172 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.9 ms