Protein–RNA interactions for Protein: Q03146

Ddr1, Epithelial discoidin domain-containing receptor 1, mousemouse

Predictions only

Length 911 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ddr1Q03146 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Ddr1Q03146 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Ddr1Q03146 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Ddr1Q03146 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Ddr1Q03146 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Ddr1Q03146 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Ddr1Q03146 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Ddr1Q03146 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Ddr1Q03146 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Ddr1Q03146 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
Ddr1Q03146 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Ddr1Q03146 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Ddr1Q03146 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Ddr1Q03146 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
Ddr1Q03146 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Ddr1Q03146 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Ddr1Q03146 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Ddr1Q03146 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Ddr1Q03146 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Ddr1Q03146 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Ddr1Q03146 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Ddr1Q03146 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Ddr1Q03146 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Ddr1Q03146 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Ddr1Q03146 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Ddr1Q03146 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Ddr1Q03146 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Ddr1Q03146 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Ddr1Q03146 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Ddr1Q03146 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Ddr1Q03146 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Ddr1Q03146 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Ddr1Q03146 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Ddr1Q03146 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Ddr1Q03146 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Ddr1Q03146 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Ddr1Q03146 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Ddr1Q03146 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Ddr1Q03146 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Ddr1Q03146 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Ddr1Q03146 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Ddr1Q03146 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Ddr1Q03146 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Ddr1Q03146 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Ddr1Q03146 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Ddr1Q03146 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Ddr1Q03146 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Ddr1Q03146 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Ddr1Q03146 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Ddr1Q03146 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
Ddr1Q03146 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Ddr1Q03146 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Ddr1Q03146 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Ddr1Q03146 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Ddr1Q03146 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Ddr1Q03146 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Ddr1Q03146 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Ddr1Q03146 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Ddr1Q03146 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Ddr1Q03146 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Ddr1Q03146 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Ddr1Q03146 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Ddr1Q03146 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Ddr1Q03146 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Ddr1Q03146 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Ddr1Q03146 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Ddr1Q03146 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
Ddr1Q03146 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Ddr1Q03146 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Ddr1Q03146 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Ddr1Q03146 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Ddr1Q03146 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Ddr1Q03146 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Ddr1Q03146 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Ddr1Q03146 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Ddr1Q03146 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Ddr1Q03146 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Ddr1Q03146 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Ddr1Q03146 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Ddr1Q03146 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Ddr1Q03146 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Ddr1Q03146 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Ddr1Q03146 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Ddr1Q03146 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Ddr1Q03146 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Ddr1Q03146 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Ddr1Q03146 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Ddr1Q03146 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Ddr1Q03146 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
Ddr1Q03146 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Ddr1Q03146 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Ddr1Q03146 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Ddr1Q03146 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Ddr1Q03146 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Ddr1Q03146 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Ddr1Q03146 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Ddr1Q03146 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Ddr1Q03146 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Ddr1Q03146 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Ddr1Q03146 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.2 ms