Protein–RNA interactions for Protein: Q01279

Egfr, Epidermal growth factor receptor, mousemouse

Predictions only

Length 1,210 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EgfrQ01279 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
EgfrQ01279 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC28.26■■■□□ 2.11
EgfrQ01279 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
EgfrQ01279 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
EgfrQ01279 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC28.25■■■□□ 2.11
EgfrQ01279 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
EgfrQ01279 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC28.25■■■□□ 2.11
EgfrQ01279 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
EgfrQ01279 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
EgfrQ01279 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
EgfrQ01279 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
EgfrQ01279 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
EgfrQ01279 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
EgfrQ01279 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
EgfrQ01279 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
EgfrQ01279 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
EgfrQ01279 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
EgfrQ01279 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC28.22■■■□□ 2.11
EgfrQ01279 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
EgfrQ01279 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
EgfrQ01279 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC28.21■■■□□ 2.11
EgfrQ01279 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
EgfrQ01279 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.11
EgfrQ01279 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
EgfrQ01279 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
EgfrQ01279 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
EgfrQ01279 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC28.19■■■□□ 2.1
EgfrQ01279 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
EgfrQ01279 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
EgfrQ01279 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
EgfrQ01279 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
EgfrQ01279 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC28.17■■■□□ 2.1
EgfrQ01279 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC28.17■■■□□ 2.1
EgfrQ01279 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.17■■■□□ 2.1
EgfrQ01279 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
EgfrQ01279 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
EgfrQ01279 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
EgfrQ01279 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
EgfrQ01279 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
EgfrQ01279 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC28.15■■■□□ 2.1
EgfrQ01279 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.1
EgfrQ01279 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
EgfrQ01279 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
EgfrQ01279 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC28.14■■■□□ 2.1
EgfrQ01279 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
EgfrQ01279 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
EgfrQ01279 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
EgfrQ01279 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC28.13■■■□□ 2.09
EgfrQ01279 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
EgfrQ01279 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
EgfrQ01279 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
EgfrQ01279 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
EgfrQ01279 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
EgfrQ01279 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
EgfrQ01279 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
EgfrQ01279 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
EgfrQ01279 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC28.1■■■□□ 2.09
EgfrQ01279 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
EgfrQ01279 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
EgfrQ01279 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC28.09■■■□□ 2.09
EgfrQ01279 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
EgfrQ01279 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
EgfrQ01279 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
EgfrQ01279 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
EgfrQ01279 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
EgfrQ01279 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC28.07■■■□□ 2.08
EgfrQ01279 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
EgfrQ01279 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
EgfrQ01279 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
EgfrQ01279 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC28.05■■■□□ 2.08
EgfrQ01279 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC28.05■■■□□ 2.08
EgfrQ01279 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
EgfrQ01279 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
EgfrQ01279 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC28.03■■■□□ 2.08
EgfrQ01279 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
EgfrQ01279 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
EgfrQ01279 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
EgfrQ01279 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
EgfrQ01279 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
EgfrQ01279 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
EgfrQ01279 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
EgfrQ01279 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
EgfrQ01279 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
EgfrQ01279 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
EgfrQ01279 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC28■■■□□ 2.07
EgfrQ01279 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC28■■■□□ 2.07
EgfrQ01279 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
EgfrQ01279 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
EgfrQ01279 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
EgfrQ01279 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
EgfrQ01279 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
EgfrQ01279 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
EgfrQ01279 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
EgfrQ01279 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
EgfrQ01279 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
EgfrQ01279 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC27.97■■■□□ 2.07
EgfrQ01279 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
EgfrQ01279 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
EgfrQ01279 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
EgfrQ01279 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.2 ms