Protein–RNA interactions for Protein: Q00896

Serpina1c, Alpha-1-antitrypsin 1-3, mousemouse

Predictions only

Length 412 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Serpina1cQ00896 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Serpina1cQ00896 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Serpina1cQ00896 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Serpina1cQ00896 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Serpina1cQ00896 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Serpina1cQ00896 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Serpina1cQ00896 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Serpina1cQ00896 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Serpina1cQ00896 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Serpina1cQ00896 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Serpina1cQ00896 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Serpina1cQ00896 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
Serpina1cQ00896 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Serpina1cQ00896 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Serpina1cQ00896 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
Serpina1cQ00896 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Serpina1cQ00896 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Serpina1cQ00896 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Serpina1cQ00896 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC25.14■■□□□ 1.62
Serpina1cQ00896 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC25.14■■□□□ 1.61
Serpina1cQ00896 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Serpina1cQ00896 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Serpina1cQ00896 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Serpina1cQ00896 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Serpina1cQ00896 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Serpina1cQ00896 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Serpina1cQ00896 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Serpina1cQ00896 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Serpina1cQ00896 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Serpina1cQ00896 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Serpina1cQ00896 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Serpina1cQ00896 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Serpina1cQ00896 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Serpina1cQ00896 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Serpina1cQ00896 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Serpina1cQ00896 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Serpina1cQ00896 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Serpina1cQ00896 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Serpina1cQ00896 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
Serpina1cQ00896 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Serpina1cQ00896 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
Serpina1cQ00896 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC25.08■■□□□ 1.61
Serpina1cQ00896 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
Serpina1cQ00896 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC25.08■■□□□ 1.61
Serpina1cQ00896 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Serpina1cQ00896 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Serpina1cQ00896 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Serpina1cQ00896 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Serpina1cQ00896 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Serpina1cQ00896 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Serpina1cQ00896 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
Serpina1cQ00896 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Serpina1cQ00896 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Serpina1cQ00896 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Serpina1cQ00896 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Serpina1cQ00896 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Serpina1cQ00896 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Serpina1cQ00896 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Serpina1cQ00896 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Serpina1cQ00896 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Serpina1cQ00896 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
Serpina1cQ00896 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Serpina1cQ00896 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
Serpina1cQ00896 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Serpina1cQ00896 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Serpina1cQ00896 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Serpina1cQ00896 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Serpina1cQ00896 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Serpina1cQ00896 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Serpina1cQ00896 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
Serpina1cQ00896 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Serpina1cQ00896 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Serpina1cQ00896 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Serpina1cQ00896 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Serpina1cQ00896 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC25■■□□□ 1.59
Serpina1cQ00896 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Serpina1cQ00896 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
Serpina1cQ00896 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Serpina1cQ00896 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Serpina1cQ00896 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Serpina1cQ00896 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Serpina1cQ00896 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Serpina1cQ00896 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Serpina1cQ00896 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Serpina1cQ00896 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Serpina1cQ00896 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Serpina1cQ00896 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Serpina1cQ00896 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Serpina1cQ00896 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Serpina1cQ00896 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Serpina1cQ00896 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Serpina1cQ00896 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Serpina1cQ00896 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Serpina1cQ00896 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Serpina1cQ00896 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Serpina1cQ00896 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Serpina1cQ00896 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
Serpina1cQ00896 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Serpina1cQ00896 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
Serpina1cQ00896 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 101.3 ms