Protein–RNA interactions for Protein: P97929

Brca2, Breast cancer type 2 susceptibility protein homolog, mousemouse

Predictions only

Length 3,329 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Brca2P97929 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Brca2P97929 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Brca2P97929 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Brca2P97929 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Brca2P97929 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Brca2P97929 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Brca2P97929 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Brca2P97929 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Brca2P97929 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Brca2P97929 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
Brca2P97929 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Brca2P97929 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Brca2P97929 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Brca2P97929 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Brca2P97929 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Brca2P97929 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
Brca2P97929 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Brca2P97929 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Brca2P97929 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Brca2P97929 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Brca2P97929 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
Brca2P97929 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
Brca2P97929 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Brca2P97929 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Brca2P97929 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Brca2P97929 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Brca2P97929 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Brca2P97929 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Brca2P97929 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
Brca2P97929 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Brca2P97929 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
Brca2P97929 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Brca2P97929 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Brca2P97929 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Brca2P97929 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
Brca2P97929 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Brca2P97929 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Brca2P97929 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Brca2P97929 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Brca2P97929 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Brca2P97929 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Brca2P97929 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Brca2P97929 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Brca2P97929 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Brca2P97929 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Brca2P97929 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Brca2P97929 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Brca2P97929 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Brca2P97929 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Brca2P97929 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Brca2P97929 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Brca2P97929 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Brca2P97929 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Brca2P97929 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Brca2P97929 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Brca2P97929 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Brca2P97929 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Brca2P97929 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Brca2P97929 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Brca2P97929 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Brca2P97929 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Brca2P97929 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Brca2P97929 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Brca2P97929 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Brca2P97929 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Brca2P97929 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Brca2P97929 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Brca2P97929 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Brca2P97929 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Brca2P97929 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Brca2P97929 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Brca2P97929 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Brca2P97929 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Brca2P97929 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Brca2P97929 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Brca2P97929 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Brca2P97929 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Brca2P97929 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Brca2P97929 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Brca2P97929 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Brca2P97929 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
Brca2P97929 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Brca2P97929 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Brca2P97929 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Brca2P97929 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Brca2P97929 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Brca2P97929 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Brca2P97929 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Brca2P97929 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
Brca2P97929 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Brca2P97929 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Brca2P97929 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Brca2P97929 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Brca2P97929 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Brca2P97929 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Brca2P97929 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Brca2P97929 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Brca2P97929 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Brca2P97929 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Brca2P97929 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 70.8 ms