Protein–RNA interactions for Protein: P97793

Alk, ALK tyrosine kinase receptor, mousemouse

Predictions only

Length 1,621 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AlkP97793 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC33.77■■■■□ 3
AlkP97793 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.76■■■■□ 3
AlkP97793 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.76■■■■□ 3
AlkP97793 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC33.76■■■■□ 3
AlkP97793 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC33.76■■■□□ 2.99
AlkP97793 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC33.75■■■□□ 2.99
AlkP97793 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC33.75■■■□□ 2.99
AlkP97793 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC33.75■■■□□ 2.99
AlkP97793 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC33.75■■■□□ 2.99
AlkP97793 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.74■■■□□ 2.99
AlkP97793 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC33.74■■■□□ 2.99
AlkP97793 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.73■■■□□ 2.99
AlkP97793 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.72■■■□□ 2.99
AlkP97793 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.72■■■□□ 2.99
AlkP97793 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.71■■■□□ 2.99
AlkP97793 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.71■■■□□ 2.99
AlkP97793 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC33.71■■■□□ 2.99
AlkP97793 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC33.71■■■□□ 2.99
AlkP97793 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC33.71■■■□□ 2.99
AlkP97793 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.7■■■□□ 2.99
AlkP97793 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.7■■■□□ 2.99
AlkP97793 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.7■■■□□ 2.98
AlkP97793 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.69■■■□□ 2.98
AlkP97793 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC33.69■■■□□ 2.98
AlkP97793 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.69■■■□□ 2.98
AlkP97793 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC33.69■■■□□ 2.98
AlkP97793 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.69■■■□□ 2.98
AlkP97793 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.69■■■□□ 2.98
AlkP97793 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.69■■■□□ 2.98
AlkP97793 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC33.68■■■□□ 2.98
AlkP97793 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC33.68■■■□□ 2.98
AlkP97793 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.68■■■□□ 2.98
AlkP97793 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.68■■■□□ 2.98
AlkP97793 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC33.68■■■□□ 2.98
AlkP97793 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC33.68■■■□□ 2.98
AlkP97793 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC33.68■■■□□ 2.98
AlkP97793 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC33.67■■■□□ 2.98
AlkP97793 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC33.66■■■□□ 2.98
AlkP97793 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.66■■■□□ 2.98
AlkP97793 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.65■■■□□ 2.98
AlkP97793 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC33.65■■■□□ 2.98
AlkP97793 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.65■■■□□ 2.98
AlkP97793 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.64■■■□□ 2.98
AlkP97793 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC33.64■■■□□ 2.98
AlkP97793 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.63■■■□□ 2.97
AlkP97793 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.63■■■□□ 2.97
AlkP97793 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.61■■■□□ 2.97
AlkP97793 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.61■■■□□ 2.97
AlkP97793 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC33.61■■■□□ 2.97
AlkP97793 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC33.61■■■□□ 2.97
AlkP97793 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.61■■■□□ 2.97
AlkP97793 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.61■■■□□ 2.97
AlkP97793 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC33.61■■■□□ 2.97
AlkP97793 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC33.61■■■□□ 2.97
AlkP97793 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC33.58■■■□□ 2.97
AlkP97793 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC33.58■■■□□ 2.97
AlkP97793 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.58■■■□□ 2.97
AlkP97793 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC33.58■■■□□ 2.97
AlkP97793 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC33.57■■■□□ 2.96
AlkP97793 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC33.55■■■□□ 2.96
AlkP97793 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.54■■■□□ 2.96
AlkP97793 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC33.53■■■□□ 2.96
AlkP97793 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC33.52■■■□□ 2.96
AlkP97793 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.51■■■□□ 2.95
AlkP97793 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.5■■■□□ 2.95
AlkP97793 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC33.5■■■□□ 2.95
AlkP97793 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC33.5■■■□□ 2.95
AlkP97793 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC33.5■■■□□ 2.95
AlkP97793 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC33.49■■■□□ 2.95
AlkP97793 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.49■■■□□ 2.95
AlkP97793 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC33.49■■■□□ 2.95
AlkP97793 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.48■■■□□ 2.95
AlkP97793 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.48■■■□□ 2.95
AlkP97793 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.48■■■□□ 2.95
AlkP97793 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.46■■■□□ 2.95
AlkP97793 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC33.46■■■□□ 2.95
AlkP97793 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.46■■■□□ 2.95
AlkP97793 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC33.46■■■□□ 2.95
AlkP97793 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC33.46■■■□□ 2.95
AlkP97793 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.45■■■□□ 2.94
AlkP97793 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC33.44■■■□□ 2.94
AlkP97793 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.43■■■□□ 2.94
AlkP97793 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.43■■■□□ 2.94
AlkP97793 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.43■■■□□ 2.94
AlkP97793 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.43■■■□□ 2.94
AlkP97793 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC33.42■■■□□ 2.94
AlkP97793 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.42■■■□□ 2.94
AlkP97793 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.4■■■□□ 2.94
AlkP97793 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.4■■■□□ 2.94
AlkP97793 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC33.4■■■□□ 2.94
AlkP97793 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.4■■■□□ 2.94
AlkP97793 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC33.4■■■□□ 2.94
AlkP97793 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC33.39■■■□□ 2.94
AlkP97793 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.39■■■□□ 2.94
AlkP97793 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC33.39■■■□□ 2.94
AlkP97793 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC33.39■■■□□ 2.94
AlkP97793 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC33.39■■■□□ 2.94
AlkP97793 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC33.39■■■□□ 2.93
AlkP97793 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC33.38■■■□□ 2.93
AlkP97793 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.38■■■□□ 2.93
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.5 ms