Protein–RNA interactions for Protein: P97386

Lig3, DNA ligase 3, mousemouse

Predictions only

Length 1,015 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lig3P97386 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
Lig3P97386 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Lig3P97386 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Lig3P97386 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Lig3P97386 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Lig3P97386 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Lig3P97386 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Lig3P97386 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Lig3P97386 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Lig3P97386 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Lig3P97386 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Lig3P97386 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Lig3P97386 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Lig3P97386 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Lig3P97386 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Lig3P97386 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Lig3P97386 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Lig3P97386 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Lig3P97386 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Lig3P97386 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
Lig3P97386 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Lig3P97386 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Lig3P97386 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Lig3P97386 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Lig3P97386 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
Lig3P97386 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Lig3P97386 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Lig3P97386 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Lig3P97386 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Lig3P97386 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Lig3P97386 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Lig3P97386 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Lig3P97386 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Lig3P97386 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Lig3P97386 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Lig3P97386 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC24.39■■□□□ 1.5
Lig3P97386 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Lig3P97386 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Lig3P97386 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Lig3P97386 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Lig3P97386 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Lig3P97386 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Lig3P97386 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Lig3P97386 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
Lig3P97386 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Lig3P97386 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Lig3P97386 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Lig3P97386 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Lig3P97386 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Lig3P97386 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Lig3P97386 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Lig3P97386 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Lig3P97386 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Lig3P97386 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
Lig3P97386 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Lig3P97386 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Lig3P97386 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Lig3P97386 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Lig3P97386 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Lig3P97386 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Lig3P97386 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Lig3P97386 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Lig3P97386 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Lig3P97386 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Lig3P97386 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Lig3P97386 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Lig3P97386 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Lig3P97386 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Lig3P97386 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Lig3P97386 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Lig3P97386 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
Lig3P97386 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Lig3P97386 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Lig3P97386 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Lig3P97386 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
Lig3P97386 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
Lig3P97386 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Lig3P97386 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Lig3P97386 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
Lig3P97386 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Lig3P97386 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Lig3P97386 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Lig3P97386 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Lig3P97386 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Lig3P97386 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
Lig3P97386 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Lig3P97386 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Lig3P97386 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Lig3P97386 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Lig3P97386 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Lig3P97386 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Lig3P97386 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Lig3P97386 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Lig3P97386 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
Lig3P97386 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Lig3P97386 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Lig3P97386 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Lig3P97386 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Lig3P97386 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
Lig3P97386 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 109.9 ms