Protein–RNA interactions for Protein: P85442

Vgll3, Transcription cofactor vestigial-like protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 326 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vgll3P85442 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
Vgll3P85442 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Vgll3P85442 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Vgll3P85442 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Vgll3P85442 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Vgll3P85442 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Vgll3P85442 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Vgll3P85442 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Vgll3P85442 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Vgll3P85442 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Vgll3P85442 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Vgll3P85442 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Vgll3P85442 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Vgll3P85442 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Vgll3P85442 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Vgll3P85442 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Vgll3P85442 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Vgll3P85442 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Vgll3P85442 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Vgll3P85442 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Vgll3P85442 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Vgll3P85442 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Vgll3P85442 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Vgll3P85442 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Vgll3P85442 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Vgll3P85442 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Vgll3P85442 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Vgll3P85442 4921536K21Rik-201ENSMUST00000020712 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Vgll3P85442 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Vgll3P85442 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Vgll3P85442 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Vgll3P85442 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Vgll3P85442 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Vgll3P85442 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Vgll3P85442 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Vgll3P85442 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Vgll3P85442 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Vgll3P85442 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Vgll3P85442 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
Vgll3P85442 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Vgll3P85442 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
Vgll3P85442 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Vgll3P85442 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Vgll3P85442 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Vgll3P85442 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Vgll3P85442 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Vgll3P85442 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Vgll3P85442 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Vgll3P85442 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Vgll3P85442 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Vgll3P85442 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Vgll3P85442 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Vgll3P85442 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Vgll3P85442 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Vgll3P85442 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Vgll3P85442 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Vgll3P85442 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Vgll3P85442 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Vgll3P85442 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Vgll3P85442 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Vgll3P85442 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Vgll3P85442 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Vgll3P85442 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Vgll3P85442 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Vgll3P85442 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Vgll3P85442 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Vgll3P85442 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Vgll3P85442 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Vgll3P85442 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC23■■□□□ 1.27
Vgll3P85442 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Vgll3P85442 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Vgll3P85442 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Vgll3P85442 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Vgll3P85442 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Vgll3P85442 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Vgll3P85442 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Vgll3P85442 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Vgll3P85442 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Vgll3P85442 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Vgll3P85442 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Vgll3P85442 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Vgll3P85442 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Vgll3P85442 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Vgll3P85442 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Vgll3P85442 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Vgll3P85442 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Vgll3P85442 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Vgll3P85442 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.27
Vgll3P85442 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Vgll3P85442 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Vgll3P85442 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Vgll3P85442 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Vgll3P85442 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Vgll3P85442 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
Vgll3P85442 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Vgll3P85442 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Vgll3P85442 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Vgll3P85442 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Vgll3P85442 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
Vgll3P85442 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.5 ms