Protein–RNA interactions for Protein: P83887

Tubg1, Tubulin gamma-1 chain, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 451 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tubg1P83887 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Tubg1P83887 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Tubg1P83887 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC19.73■□□□□ 0.75
Tubg1P83887 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Tubg1P83887 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Tubg1P83887 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC19.73■□□□□ 0.75
Tubg1P83887 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Tubg1P83887 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Tubg1P83887 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Tubg1P83887 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
Tubg1P83887 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
Tubg1P83887 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Tubg1P83887 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Tubg1P83887 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Tubg1P83887 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
Tubg1P83887 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Tubg1P83887 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Tubg1P83887 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Tubg1P83887 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Tubg1P83887 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Tubg1P83887 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Tubg1P83887 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
Tubg1P83887 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
Tubg1P83887 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
Tubg1P83887 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Tubg1P83887 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Tubg1P83887 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Tubg1P83887 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Tubg1P83887 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
Tubg1P83887 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC19.67■□□□□ 0.74
Tubg1P83887 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Tubg1P83887 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Tubg1P83887 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
Tubg1P83887 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Tubg1P83887 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Tubg1P83887 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC19.66■□□□□ 0.74
Tubg1P83887 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Tubg1P83887 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Tubg1P83887 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
Tubg1P83887 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.73
Tubg1P83887 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC19.64■□□□□ 0.73
Tubg1P83887 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Tubg1P83887 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC19.64■□□□□ 0.73
Tubg1P83887 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.73
Tubg1P83887 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC19.64■□□□□ 0.73
Tubg1P83887 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Tubg1P83887 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Tubg1P83887 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
Tubg1P83887 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC19.63■□□□□ 0.73
Tubg1P83887 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Tubg1P83887 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Tubg1P83887 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Tubg1P83887 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC19.62■□□□□ 0.73
Tubg1P83887 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Tubg1P83887 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
Tubg1P83887 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
Tubg1P83887 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Tubg1P83887 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
Tubg1P83887 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Tubg1P83887 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Tubg1P83887 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Tubg1P83887 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Tubg1P83887 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Tubg1P83887 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC19.61■□□□□ 0.73
Tubg1P83887 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Tubg1P83887 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Tubg1P83887 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Tubg1P83887 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Tubg1P83887 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Tubg1P83887 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Tubg1P83887 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Tubg1P83887 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Tubg1P83887 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Tubg1P83887 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Tubg1P83887 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Tubg1P83887 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Tubg1P83887 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Tubg1P83887 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Tubg1P83887 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Tubg1P83887 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Tubg1P83887 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Tubg1P83887 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC19.58■□□□□ 0.73
Tubg1P83887 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Tubg1P83887 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Tubg1P83887 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
Tubg1P83887 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Tubg1P83887 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Tubg1P83887 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Tubg1P83887 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Tubg1P83887 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Tubg1P83887 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Tubg1P83887 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Tubg1P83887 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Tubg1P83887 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Tubg1P83887 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Tubg1P83887 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Tubg1P83887 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Tubg1P83887 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Tubg1P83887 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Tubg1P83887 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.1 ms