Protein–RNA interactions for Protein: P81066

Irx2, Iroquois-class homeodomain protein IRX-2, mousemouse

Predictions only

Length 474 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Irx2P81066 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Irx2P81066 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Irx2P81066 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Irx2P81066 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Irx2P81066 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Irx2P81066 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Irx2P81066 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Irx2P81066 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Irx2P81066 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
Irx2P81066 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Irx2P81066 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Irx2P81066 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Irx2P81066 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Irx2P81066 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Irx2P81066 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Irx2P81066 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Irx2P81066 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Irx2P81066 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Irx2P81066 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Irx2P81066 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Irx2P81066 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Irx2P81066 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Irx2P81066 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Irx2P81066 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
Irx2P81066 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Irx2P81066 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Irx2P81066 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Irx2P81066 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Irx2P81066 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Irx2P81066 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Irx2P81066 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Irx2P81066 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Irx2P81066 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Irx2P81066 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Irx2P81066 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Irx2P81066 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Irx2P81066 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Irx2P81066 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Irx2P81066 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Irx2P81066 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Irx2P81066 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Irx2P81066 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Irx2P81066 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Irx2P81066 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Irx2P81066 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
Irx2P81066 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Irx2P81066 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Irx2P81066 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
Irx2P81066 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Irx2P81066 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Irx2P81066 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Irx2P81066 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Irx2P81066 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Irx2P81066 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Irx2P81066 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Irx2P81066 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Irx2P81066 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Irx2P81066 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Irx2P81066 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Irx2P81066 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Irx2P81066 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Irx2P81066 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Irx2P81066 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Irx2P81066 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
Irx2P81066 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Irx2P81066 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Irx2P81066 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Irx2P81066 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Irx2P81066 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Irx2P81066 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Irx2P81066 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Irx2P81066 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Irx2P81066 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Irx2P81066 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Irx2P81066 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Irx2P81066 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.34
Irx2P81066 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Irx2P81066 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Irx2P81066 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Irx2P81066 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Irx2P81066 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Irx2P81066 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Irx2P81066 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Irx2P81066 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Irx2P81066 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Irx2P81066 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Irx2P81066 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Irx2P81066 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Irx2P81066 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Irx2P81066 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Irx2P81066 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Irx2P81066 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Irx2P81066 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Irx2P81066 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Irx2P81066 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Irx2P81066 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Irx2P81066 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Irx2P81066 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Irx2P81066 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Irx2P81066 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.4 ms