Protein–RNA interactions for Protein: P70414

Slc8a1, Sodium/calcium exchanger 1, mousemouse

Predictions only

Length 970 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc8a1P70414 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Slc8a1P70414 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Slc8a1P70414 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Slc8a1P70414 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Slc8a1P70414 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Slc8a1P70414 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Slc8a1P70414 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Slc8a1P70414 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Slc8a1P70414 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Slc8a1P70414 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Slc8a1P70414 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Slc8a1P70414 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Slc8a1P70414 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Slc8a1P70414 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
Slc8a1P70414 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Slc8a1P70414 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Slc8a1P70414 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Slc8a1P70414 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Slc8a1P70414 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Slc8a1P70414 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Slc8a1P70414 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Slc8a1P70414 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Slc8a1P70414 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Slc8a1P70414 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Slc8a1P70414 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Slc8a1P70414 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Slc8a1P70414 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Slc8a1P70414 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Slc8a1P70414 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Slc8a1P70414 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Slc8a1P70414 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Slc8a1P70414 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Slc8a1P70414 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Slc8a1P70414 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Slc8a1P70414 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Slc8a1P70414 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
Slc8a1P70414 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Slc8a1P70414 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Slc8a1P70414 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Slc8a1P70414 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Slc8a1P70414 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Slc8a1P70414 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Slc8a1P70414 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Slc8a1P70414 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Slc8a1P70414 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Slc8a1P70414 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Slc8a1P70414 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Slc8a1P70414 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
Slc8a1P70414 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Slc8a1P70414 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Slc8a1P70414 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Slc8a1P70414 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Slc8a1P70414 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Slc8a1P70414 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Slc8a1P70414 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Slc8a1P70414 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Slc8a1P70414 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Slc8a1P70414 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Slc8a1P70414 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Slc8a1P70414 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Slc8a1P70414 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Slc8a1P70414 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Slc8a1P70414 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Slc8a1P70414 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Slc8a1P70414 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Slc8a1P70414 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Slc8a1P70414 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Slc8a1P70414 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Slc8a1P70414 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Slc8a1P70414 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Slc8a1P70414 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Slc8a1P70414 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Slc8a1P70414 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Slc8a1P70414 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Slc8a1P70414 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Slc8a1P70414 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Slc8a1P70414 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Slc8a1P70414 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Slc8a1P70414 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Slc8a1P70414 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Slc8a1P70414 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Slc8a1P70414 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Slc8a1P70414 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Slc8a1P70414 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Slc8a1P70414 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Slc8a1P70414 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Slc8a1P70414 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Slc8a1P70414 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Slc8a1P70414 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Slc8a1P70414 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Slc8a1P70414 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Slc8a1P70414 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Slc8a1P70414 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Slc8a1P70414 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Slc8a1P70414 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Slc8a1P70414 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Slc8a1P70414 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Slc8a1P70414 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Slc8a1P70414 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Slc8a1P70414 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.5 ms