Protein–RNA interactions for Protein: P70407

Cdh9, Cadherin-9, mousemouse

Predictions only

Length 786 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdh9P70407 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Cdh9P70407 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Cdh9P70407 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Cdh9P70407 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Cdh9P70407 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Cdh9P70407 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Cdh9P70407 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Cdh9P70407 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Cdh9P70407 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Cdh9P70407 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Cdh9P70407 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Cdh9P70407 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Cdh9P70407 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Cdh9P70407 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Cdh9P70407 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Cdh9P70407 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Cdh9P70407 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Cdh9P70407 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Cdh9P70407 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Cdh9P70407 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Cdh9P70407 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Cdh9P70407 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Cdh9P70407 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Cdh9P70407 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Cdh9P70407 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Cdh9P70407 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Cdh9P70407 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Cdh9P70407 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Cdh9P70407 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Cdh9P70407 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Cdh9P70407 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Cdh9P70407 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Cdh9P70407 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Cdh9P70407 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Cdh9P70407 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Cdh9P70407 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Cdh9P70407 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Cdh9P70407 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Cdh9P70407 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Cdh9P70407 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Cdh9P70407 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Cdh9P70407 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
Cdh9P70407 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Cdh9P70407 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Cdh9P70407 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Cdh9P70407 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Cdh9P70407 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Cdh9P70407 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Cdh9P70407 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Cdh9P70407 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Cdh9P70407 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Cdh9P70407 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Cdh9P70407 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Cdh9P70407 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Cdh9P70407 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Cdh9P70407 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Cdh9P70407 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Cdh9P70407 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Cdh9P70407 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Cdh9P70407 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Cdh9P70407 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Cdh9P70407 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Cdh9P70407 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Cdh9P70407 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Cdh9P70407 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Cdh9P70407 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Cdh9P70407 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Cdh9P70407 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Cdh9P70407 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
Cdh9P70407 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Cdh9P70407 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Cdh9P70407 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Cdh9P70407 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Cdh9P70407 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Cdh9P70407 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Cdh9P70407 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Cdh9P70407 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Cdh9P70407 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
Cdh9P70407 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Cdh9P70407 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Cdh9P70407 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Cdh9P70407 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Cdh9P70407 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Cdh9P70407 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Cdh9P70407 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Cdh9P70407 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Cdh9P70407 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Cdh9P70407 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Cdh9P70407 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Cdh9P70407 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Cdh9P70407 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
Cdh9P70407 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
Cdh9P70407 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Cdh9P70407 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
Cdh9P70407 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Cdh9P70407 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
Cdh9P70407 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
Cdh9P70407 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Cdh9P70407 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Cdh9P70407 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 118.2 ms