Protein–RNA interactions for Protein: P70327

Tbx6, T-box transcription factor TBX6, mousemouse

Predictions only

Length 436 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tbx6P70327 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Tbx6P70327 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Tbx6P70327 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Tbx6P70327 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Tbx6P70327 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Tbx6P70327 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Tbx6P70327 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Tbx6P70327 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Tbx6P70327 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
Tbx6P70327 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
Tbx6P70327 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Tbx6P70327 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Tbx6P70327 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
Tbx6P70327 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Tbx6P70327 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Tbx6P70327 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC21.64■■□□□ 1.06
Tbx6P70327 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Tbx6P70327 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Tbx6P70327 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Tbx6P70327 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Tbx6P70327 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Tbx6P70327 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Tbx6P70327 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Tbx6P70327 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Tbx6P70327 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Tbx6P70327 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Tbx6P70327 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Tbx6P70327 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Tbx6P70327 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Tbx6P70327 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Tbx6P70327 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Tbx6P70327 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Tbx6P70327 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Tbx6P70327 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Tbx6P70327 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Tbx6P70327 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Tbx6P70327 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Tbx6P70327 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Tbx6P70327 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Tbx6P70327 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Tbx6P70327 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Tbx6P70327 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Tbx6P70327 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Tbx6P70327 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Tbx6P70327 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Tbx6P70327 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Tbx6P70327 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Tbx6P70327 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Tbx6P70327 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Tbx6P70327 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Tbx6P70327 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Tbx6P70327 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Tbx6P70327 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Tbx6P70327 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Tbx6P70327 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Tbx6P70327 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Tbx6P70327 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Tbx6P70327 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
Tbx6P70327 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
Tbx6P70327 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Tbx6P70327 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Tbx6P70327 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
Tbx6P70327 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Tbx6P70327 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
Tbx6P70327 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
Tbx6P70327 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Tbx6P70327 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Tbx6P70327 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Tbx6P70327 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Tbx6P70327 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Tbx6P70327 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Tbx6P70327 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Tbx6P70327 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Tbx6P70327 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Tbx6P70327 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Tbx6P70327 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Tbx6P70327 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Tbx6P70327 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Tbx6P70327 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Tbx6P70327 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Tbx6P70327 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Tbx6P70327 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Tbx6P70327 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Tbx6P70327 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Tbx6P70327 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Tbx6P70327 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Tbx6P70327 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Tbx6P70327 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Tbx6P70327 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Tbx6P70327 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Tbx6P70327 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Tbx6P70327 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Tbx6P70327 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Tbx6P70327 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Tbx6P70327 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Tbx6P70327 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Tbx6P70327 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Tbx6P70327 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Tbx6P70327 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Tbx6P70327 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 80.7 ms