Protein–RNA interactions for Protein: P70160

Calca, Calcitonin, mousemouse

Predictions only

Length 136 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CalcaP70160 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
CalcaP70160 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
CalcaP70160 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC27.62■■■□□ 2.01
CalcaP70160 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
CalcaP70160 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
CalcaP70160 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
CalcaP70160 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC27.61■■■□□ 2.01
CalcaP70160 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
CalcaP70160 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
CalcaP70160 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
CalcaP70160 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
CalcaP70160 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
CalcaP70160 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
CalcaP70160 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
CalcaP70160 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
CalcaP70160 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
CalcaP70160 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
CalcaP70160 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
CalcaP70160 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
CalcaP70160 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
CalcaP70160 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
CalcaP70160 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC27.56■■■□□ 2
CalcaP70160 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
CalcaP70160 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
CalcaP70160 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
CalcaP70160 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
CalcaP70160 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
CalcaP70160 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
CalcaP70160 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
CalcaP70160 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
CalcaP70160 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
CalcaP70160 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
CalcaP70160 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.53■■■□□ 2
CalcaP70160 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
CalcaP70160 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC27.52■■■□□ 2
CalcaP70160 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
CalcaP70160 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
CalcaP70160 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
CalcaP70160 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
CalcaP70160 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC27.5■■□□□ 1.99
CalcaP70160 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC27.5■■□□□ 1.99
CalcaP70160 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
CalcaP70160 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
CalcaP70160 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC27.48■■□□□ 1.99
CalcaP70160 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
CalcaP70160 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
CalcaP70160 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC27.48■■□□□ 1.99
CalcaP70160 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
CalcaP70160 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
CalcaP70160 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
CalcaP70160 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
CalcaP70160 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC27.47■■□□□ 1.99
CalcaP70160 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
CalcaP70160 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
CalcaP70160 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
CalcaP70160 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
CalcaP70160 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
CalcaP70160 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
CalcaP70160 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
CalcaP70160 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
CalcaP70160 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
CalcaP70160 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.98
CalcaP70160 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
CalcaP70160 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC27.44■■□□□ 1.98
CalcaP70160 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
CalcaP70160 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
CalcaP70160 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
CalcaP70160 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
CalcaP70160 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
CalcaP70160 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
CalcaP70160 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
CalcaP70160 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
CalcaP70160 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC27.43■■□□□ 1.98
CalcaP70160 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
CalcaP70160 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
CalcaP70160 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
CalcaP70160 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC27.4■■□□□ 1.98
CalcaP70160 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
CalcaP70160 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
CalcaP70160 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
CalcaP70160 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
CalcaP70160 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
CalcaP70160 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
CalcaP70160 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
CalcaP70160 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC27.38■■□□□ 1.97
CalcaP70160 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
CalcaP70160 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
CalcaP70160 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
CalcaP70160 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC27.38■■□□□ 1.97
CalcaP70160 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
CalcaP70160 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
CalcaP70160 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
CalcaP70160 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
CalcaP70160 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
CalcaP70160 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC27.36■■□□□ 1.97
CalcaP70160 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC27.36■■□□□ 1.97
CalcaP70160 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC27.35■■□□□ 1.97
CalcaP70160 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
CalcaP70160 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC27.34■■□□□ 1.97
CalcaP70160 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11 ms