Protein–RNA interactions for Protein: P62301

Rps13, 40S ribosomal protein S13, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 151 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rps13P62301 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Rps13P62301 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Rps13P62301 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Rps13P62301 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Rps13P62301 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Rps13P62301 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Rps13P62301 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Rps13P62301 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Rps13P62301 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Rps13P62301 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Rps13P62301 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Rps13P62301 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Rps13P62301 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Rps13P62301 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
Rps13P62301 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Rps13P62301 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
Rps13P62301 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Rps13P62301 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Rps13P62301 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
Rps13P62301 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Rps13P62301 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Rps13P62301 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Rps13P62301 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Rps13P62301 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Rps13P62301 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Rps13P62301 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Rps13P62301 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Rps13P62301 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Rps13P62301 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Rps13P62301 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Rps13P62301 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Rps13P62301 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Rps13P62301 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Rps13P62301 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Rps13P62301 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Rps13P62301 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Rps13P62301 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Rps13P62301 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Rps13P62301 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Rps13P62301 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
Rps13P62301 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
Rps13P62301 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Rps13P62301 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Rps13P62301 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Rps13P62301 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Rps13P62301 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Rps13P62301 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Rps13P62301 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Rps13P62301 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Rps13P62301 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Rps13P62301 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Rps13P62301 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Rps13P62301 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Rps13P62301 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Rps13P62301 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Rps13P62301 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Rps13P62301 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Rps13P62301 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Rps13P62301 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Rps13P62301 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Rps13P62301 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Rps13P62301 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Rps13P62301 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Rps13P62301 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
Rps13P62301 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Rps13P62301 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Rps13P62301 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Rps13P62301 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Rps13P62301 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Rps13P62301 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Rps13P62301 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
Rps13P62301 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Rps13P62301 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
Rps13P62301 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
Rps13P62301 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Rps13P62301 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Rps13P62301 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Rps13P62301 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Rps13P62301 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Rps13P62301 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Rps13P62301 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
Rps13P62301 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Rps13P62301 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Rps13P62301 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Rps13P62301 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Rps13P62301 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Rps13P62301 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Rps13P62301 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Rps13P62301 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Rps13P62301 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Rps13P62301 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
Rps13P62301 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Rps13P62301 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
Rps13P62301 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Rps13P62301 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Rps13P62301 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Rps13P62301 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Rps13P62301 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Rps13P62301 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Rps13P62301 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 8.7 ms