Protein–RNA interactions for Protein: P62274

Rps29, 40S ribosomal protein S29, mousemouse

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Length 56 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rps29P62274 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Rps29P62274 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Rps29P62274 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Rps29P62274 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Rps29P62274 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Rps29P62274 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Rps29P62274 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Rps29P62274 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Rps29P62274 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Rps29P62274 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Rps29P62274 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Rps29P62274 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
Rps29P62274 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Rps29P62274 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Rps29P62274 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Rps29P62274 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Rps29P62274 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Rps29P62274 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Rps29P62274 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Rps29P62274 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Rps29P62274 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Rps29P62274 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Rps29P62274 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Rps29P62274 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Rps29P62274 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Rps29P62274 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Rps29P62274 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Rps29P62274 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Rps29P62274 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Rps29P62274 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Rps29P62274 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Rps29P62274 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Rps29P62274 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Rps29P62274 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Rps29P62274 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
Rps29P62274 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Rps29P62274 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Rps29P62274 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Rps29P62274 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Rps29P62274 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Rps29P62274 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Rps29P62274 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Rps29P62274 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Rps29P62274 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Rps29P62274 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Rps29P62274 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Rps29P62274 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Rps29P62274 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Rps29P62274 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Rps29P62274 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Rps29P62274 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Rps29P62274 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Rps29P62274 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Rps29P62274 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Rps29P62274 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Rps29P62274 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Rps29P62274 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Rps29P62274 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Rps29P62274 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Rps29P62274 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
Rps29P62274 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC12.83□□□□□ -0.35
Rps29P62274 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC12.83□□□□□ -0.35
Rps29P62274 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Rps29P62274 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Rps29P62274 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Rps29P62274 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Rps29P62274 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Rps29P62274 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Rps29P62274 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Rps29P62274 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC12.82□□□□□ -0.36
Rps29P62274 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Rps29P62274 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Rps29P62274 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Rps29P62274 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC12.82□□□□□ -0.36
Rps29P62274 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Rps29P62274 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Rps29P62274 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Rps29P62274 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
Rps29P62274 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
Rps29P62274 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Rps29P62274 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Rps29P62274 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC12.81□□□□□ -0.36
Rps29P62274 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.81□□□□□ -0.36
Rps29P62274 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Rps29P62274 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Rps29P62274 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Rps29P62274 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Rps29P62274 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC12.8□□□□□ -0.36
Rps29P62274 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC12.8□□□□□ -0.36
Rps29P62274 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Rps29P62274 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Rps29P62274 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Rps29P62274 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Rps29P62274 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Rps29P62274 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Rps29P62274 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Rps29P62274 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Rps29P62274 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Rps29P62274 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Rps29P62274 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
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