Protein–RNA interactions for Protein: P61961

Ufm1, Ubiquitin-fold modifier 1, mousemouse

Predictions only

Length 85 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ufm1P61961 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Ufm1P61961 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Ufm1P61961 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Ufm1P61961 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Ufm1P61961 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
Ufm1P61961 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Ufm1P61961 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Ufm1P61961 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Ufm1P61961 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
Ufm1P61961 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Ufm1P61961 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Ufm1P61961 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Ufm1P61961 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Ufm1P61961 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Ufm1P61961 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Ufm1P61961 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Ufm1P61961 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Ufm1P61961 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Ufm1P61961 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Ufm1P61961 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Ufm1P61961 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Ufm1P61961 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Ufm1P61961 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Ufm1P61961 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Ufm1P61961 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
Ufm1P61961 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Ufm1P61961 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Ufm1P61961 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Ufm1P61961 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Ufm1P61961 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
Ufm1P61961 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Ufm1P61961 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Ufm1P61961 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Ufm1P61961 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Ufm1P61961 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Ufm1P61961 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Ufm1P61961 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Ufm1P61961 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Ufm1P61961 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Ufm1P61961 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Ufm1P61961 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Ufm1P61961 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Ufm1P61961 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Ufm1P61961 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Ufm1P61961 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Ufm1P61961 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Ufm1P61961 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Ufm1P61961 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Ufm1P61961 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Ufm1P61961 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Ufm1P61961 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Ufm1P61961 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Ufm1P61961 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Ufm1P61961 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Ufm1P61961 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Ufm1P61961 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Ufm1P61961 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Ufm1P61961 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Ufm1P61961 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Ufm1P61961 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Ufm1P61961 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Ufm1P61961 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Ufm1P61961 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Ufm1P61961 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Ufm1P61961 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Ufm1P61961 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Ufm1P61961 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Ufm1P61961 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Ufm1P61961 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Ufm1P61961 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Ufm1P61961 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Ufm1P61961 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Ufm1P61961 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Ufm1P61961 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Ufm1P61961 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Ufm1P61961 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Ufm1P61961 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Ufm1P61961 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Ufm1P61961 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Ufm1P61961 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Ufm1P61961 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Ufm1P61961 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Ufm1P61961 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Ufm1P61961 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Ufm1P61961 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Ufm1P61961 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Ufm1P61961 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Ufm1P61961 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Ufm1P61961 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Ufm1P61961 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Ufm1P61961 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Ufm1P61961 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Ufm1P61961 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Ufm1P61961 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Ufm1P61961 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Ufm1P61961 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Ufm1P61961 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Ufm1P61961 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Ufm1P61961 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Ufm1P61961 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.6 ms