Protein–RNA interactions for Protein: P61759

Vbp1, Prefoldin subunit 3, mousemouse

Predictions only

Length 196 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vbp1P61759 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Vbp1P61759 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Vbp1P61759 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Vbp1P61759 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Vbp1P61759 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC20.66■□□□□ 0.9
Vbp1P61759 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Vbp1P61759 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Vbp1P61759 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Vbp1P61759 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
Vbp1P61759 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC20.65■□□□□ 0.9
Vbp1P61759 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Vbp1P61759 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
Vbp1P61759 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Vbp1P61759 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Vbp1P61759 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Vbp1P61759 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Vbp1P61759 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Vbp1P61759 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Vbp1P61759 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Vbp1P61759 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Vbp1P61759 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Vbp1P61759 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Vbp1P61759 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Vbp1P61759 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Vbp1P61759 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Vbp1P61759 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Vbp1P61759 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Vbp1P61759 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Vbp1P61759 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Vbp1P61759 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Vbp1P61759 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Vbp1P61759 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Vbp1P61759 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Vbp1P61759 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Vbp1P61759 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Vbp1P61759 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Vbp1P61759 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Vbp1P61759 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Vbp1P61759 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Vbp1P61759 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
Vbp1P61759 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.58■□□□□ 0.88
Vbp1P61759 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Vbp1P61759 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
Vbp1P61759 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
Vbp1P61759 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Vbp1P61759 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Vbp1P61759 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Vbp1P61759 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Vbp1P61759 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Vbp1P61759 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Vbp1P61759 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Vbp1P61759 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Vbp1P61759 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Vbp1P61759 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Vbp1P61759 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Vbp1P61759 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Vbp1P61759 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Vbp1P61759 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Vbp1P61759 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Vbp1P61759 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Vbp1P61759 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Vbp1P61759 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Vbp1P61759 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Vbp1P61759 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Vbp1P61759 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Vbp1P61759 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Vbp1P61759 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Vbp1P61759 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Vbp1P61759 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
Vbp1P61759 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Vbp1P61759 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Vbp1P61759 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Vbp1P61759 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Vbp1P61759 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
Vbp1P61759 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Vbp1P61759 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Vbp1P61759 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Vbp1P61759 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Vbp1P61759 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Vbp1P61759 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Vbp1P61759 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Vbp1P61759 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Vbp1P61759 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Vbp1P61759 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Vbp1P61759 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Vbp1P61759 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Vbp1P61759 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Vbp1P61759 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Vbp1P61759 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Vbp1P61759 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Vbp1P61759 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Vbp1P61759 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
Vbp1P61759 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Vbp1P61759 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Vbp1P61759 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Vbp1P61759 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Vbp1P61759 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Vbp1P61759 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Vbp1P61759 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Vbp1P61759 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59.7 ms