Protein–RNA interactions for Protein: P61407

Tdrd6, Tudor domain-containing protein 6, mousemouse

Predictions only

Length 2,134 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tdrd6P61407 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Tdrd6P61407 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Tdrd6P61407 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Tdrd6P61407 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Tdrd6P61407 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Tdrd6P61407 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
Tdrd6P61407 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Tdrd6P61407 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Tdrd6P61407 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Tdrd6P61407 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Tdrd6P61407 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Tdrd6P61407 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Tdrd6P61407 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
Tdrd6P61407 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Tdrd6P61407 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Tdrd6P61407 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Tdrd6P61407 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Tdrd6P61407 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Tdrd6P61407 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Tdrd6P61407 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Tdrd6P61407 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Tdrd6P61407 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Tdrd6P61407 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Tdrd6P61407 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Tdrd6P61407 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
Tdrd6P61407 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Tdrd6P61407 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Tdrd6P61407 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Tdrd6P61407 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Tdrd6P61407 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Tdrd6P61407 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
Tdrd6P61407 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Tdrd6P61407 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Tdrd6P61407 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
Tdrd6P61407 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Tdrd6P61407 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Tdrd6P61407 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Tdrd6P61407 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Tdrd6P61407 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Tdrd6P61407 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Tdrd6P61407 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Tdrd6P61407 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Tdrd6P61407 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Tdrd6P61407 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Tdrd6P61407 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Tdrd6P61407 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
Tdrd6P61407 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Tdrd6P61407 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Tdrd6P61407 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Tdrd6P61407 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Tdrd6P61407 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Tdrd6P61407 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Tdrd6P61407 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Tdrd6P61407 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Tdrd6P61407 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Tdrd6P61407 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
Tdrd6P61407 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
Tdrd6P61407 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
Tdrd6P61407 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
Tdrd6P61407 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Tdrd6P61407 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Tdrd6P61407 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Tdrd6P61407 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Tdrd6P61407 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Tdrd6P61407 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Tdrd6P61407 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Tdrd6P61407 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Tdrd6P61407 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Tdrd6P61407 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Tdrd6P61407 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Tdrd6P61407 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Tdrd6P61407 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Tdrd6P61407 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Tdrd6P61407 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Tdrd6P61407 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Tdrd6P61407 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
Tdrd6P61407 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Tdrd6P61407 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Tdrd6P61407 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Tdrd6P61407 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Tdrd6P61407 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Tdrd6P61407 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Tdrd6P61407 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
Tdrd6P61407 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Tdrd6P61407 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Tdrd6P61407 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Tdrd6P61407 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Tdrd6P61407 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Tdrd6P61407 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Tdrd6P61407 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Tdrd6P61407 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Tdrd6P61407 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Tdrd6P61407 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Tdrd6P61407 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Tdrd6P61407 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Tdrd6P61407 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Tdrd6P61407 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Tdrd6P61407 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
Tdrd6P61407 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Tdrd6P61407 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.8 ms