Protein–RNA interactions for Protein: P59054

Csrnp1, Cysteine/serine-rich nuclear protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 583 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Csrnp1P59054 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC27.81■■■□□ 2.04
Csrnp1P59054 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC27.81■■■□□ 2.04
Csrnp1P59054 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
Csrnp1P59054 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Csrnp1P59054 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Csrnp1P59054 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Csrnp1P59054 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
Csrnp1P59054 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Csrnp1P59054 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Csrnp1P59054 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
Csrnp1P59054 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
Csrnp1P59054 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
Csrnp1P59054 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
Csrnp1P59054 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC27.75■■■□□ 2.03
Csrnp1P59054 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Csrnp1P59054 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
Csrnp1P59054 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Csrnp1P59054 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Csrnp1P59054 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
Csrnp1P59054 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Csrnp1P59054 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Csrnp1P59054 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Csrnp1P59054 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Csrnp1P59054 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Csrnp1P59054 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC27.72■■■□□ 2.03
Csrnp1P59054 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Csrnp1P59054 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
Csrnp1P59054 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
Csrnp1P59054 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Csrnp1P59054 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Csrnp1P59054 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
Csrnp1P59054 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC27.71■■■□□ 2.03
Csrnp1P59054 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Csrnp1P59054 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
Csrnp1P59054 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
Csrnp1P59054 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
Csrnp1P59054 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
Csrnp1P59054 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
Csrnp1P59054 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
Csrnp1P59054 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Csrnp1P59054 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Csrnp1P59054 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Csrnp1P59054 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
Csrnp1P59054 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Csrnp1P59054 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Csrnp1P59054 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
Csrnp1P59054 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Csrnp1P59054 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Csrnp1P59054 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Csrnp1P59054 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
Csrnp1P59054 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
Csrnp1P59054 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
Csrnp1P59054 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Csrnp1P59054 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Csrnp1P59054 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
Csrnp1P59054 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
Csrnp1P59054 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
Csrnp1P59054 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC27.61■■■□□ 2.01
Csrnp1P59054 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Csrnp1P59054 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC27.61■■■□□ 2.01
Csrnp1P59054 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Csrnp1P59054 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Csrnp1P59054 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Csrnp1P59054 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Csrnp1P59054 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
Csrnp1P59054 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
Csrnp1P59054 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Csrnp1P59054 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC27.6■■■□□ 2.01
Csrnp1P59054 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
Csrnp1P59054 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Csrnp1P59054 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Csrnp1P59054 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC27.58■■■□□ 2.01
Csrnp1P59054 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Csrnp1P59054 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Csrnp1P59054 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Csrnp1P59054 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
Csrnp1P59054 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
Csrnp1P59054 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC27.57■■■□□ 2
Csrnp1P59054 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC27.57■■■□□ 2
Csrnp1P59054 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Csrnp1P59054 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Csrnp1P59054 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Csrnp1P59054 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Csrnp1P59054 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Csrnp1P59054 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC27.55■■■□□ 2
Csrnp1P59054 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC27.55■■■□□ 2
Csrnp1P59054 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
Csrnp1P59054 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Csrnp1P59054 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Csrnp1P59054 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC27.54■■■□□ 2
Csrnp1P59054 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
Csrnp1P59054 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Csrnp1P59054 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Csrnp1P59054 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Csrnp1P59054 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
Csrnp1P59054 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Csrnp1P59054 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.52■■■□□ 2
Csrnp1P59054 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
Csrnp1P59054 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
Csrnp1P59054 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.6 ms