Protein–RNA interactions for Protein: P57725

Samsn1, SAM domain-containing protein SAMSN-1, mousemouse

Predictions only

Length 372 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Samsn1P57725 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Samsn1P57725 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Samsn1P57725 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
Samsn1P57725 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Samsn1P57725 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Samsn1P57725 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Samsn1P57725 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Samsn1P57725 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Samsn1P57725 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Samsn1P57725 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Samsn1P57725 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Samsn1P57725 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
Samsn1P57725 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Samsn1P57725 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Samsn1P57725 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Samsn1P57725 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Samsn1P57725 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Samsn1P57725 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Samsn1P57725 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Samsn1P57725 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Samsn1P57725 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Samsn1P57725 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Samsn1P57725 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Samsn1P57725 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Samsn1P57725 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Samsn1P57725 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Samsn1P57725 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Samsn1P57725 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Samsn1P57725 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Samsn1P57725 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Samsn1P57725 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Samsn1P57725 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Samsn1P57725 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
Samsn1P57725 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Samsn1P57725 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Samsn1P57725 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Samsn1P57725 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Samsn1P57725 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Samsn1P57725 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Samsn1P57725 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Samsn1P57725 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
Samsn1P57725 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Samsn1P57725 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Samsn1P57725 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Samsn1P57725 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Samsn1P57725 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Samsn1P57725 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Samsn1P57725 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Samsn1P57725 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Samsn1P57725 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Samsn1P57725 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Samsn1P57725 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Samsn1P57725 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Samsn1P57725 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Samsn1P57725 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Samsn1P57725 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Samsn1P57725 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Samsn1P57725 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Samsn1P57725 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Samsn1P57725 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Samsn1P57725 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Samsn1P57725 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Samsn1P57725 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Samsn1P57725 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Samsn1P57725 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Samsn1P57725 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Samsn1P57725 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Samsn1P57725 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Samsn1P57725 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
Samsn1P57725 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Samsn1P57725 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Samsn1P57725 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Samsn1P57725 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Samsn1P57725 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Samsn1P57725 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Samsn1P57725 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Samsn1P57725 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Samsn1P57725 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Samsn1P57725 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Samsn1P57725 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Samsn1P57725 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Samsn1P57725 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Samsn1P57725 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Samsn1P57725 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Samsn1P57725 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Samsn1P57725 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Samsn1P57725 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Samsn1P57725 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Samsn1P57725 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Samsn1P57725 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Samsn1P57725 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Samsn1P57725 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Samsn1P57725 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Samsn1P57725 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Samsn1P57725 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Samsn1P57725 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Samsn1P57725 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Samsn1P57725 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Samsn1P57725 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Samsn1P57725 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 86.4 ms