Protein–RNA interactions for Protein: P56857

Cldn18, Claudin-18, mousemouse

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Length 264 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn18P56857 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Cldn18P56857 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Cldn18P56857 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Cldn18P56857 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Cldn18P56857 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Cldn18P56857 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Cldn18P56857 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Cldn18P56857 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
Cldn18P56857 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Cldn18P56857 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Cldn18P56857 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Cldn18P56857 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Cldn18P56857 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Cldn18P56857 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Cldn18P56857 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Cldn18P56857 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Cldn18P56857 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Cldn18P56857 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Cldn18P56857 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Cldn18P56857 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Cldn18P56857 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Cldn18P56857 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Cldn18P56857 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Cldn18P56857 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Cldn18P56857 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Cldn18P56857 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Cldn18P56857 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Cldn18P56857 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Cldn18P56857 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Cldn18P56857 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Cldn18P56857 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Cldn18P56857 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Cldn18P56857 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
Cldn18P56857 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Cldn18P56857 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Cldn18P56857 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Cldn18P56857 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
Cldn18P56857 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Cldn18P56857 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Cldn18P56857 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Cldn18P56857 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Cldn18P56857 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Cldn18P56857 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Cldn18P56857 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Cldn18P56857 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Cldn18P56857 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Cldn18P56857 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Cldn18P56857 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Cldn18P56857 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
Cldn18P56857 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
Cldn18P56857 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
Cldn18P56857 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Cldn18P56857 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Cldn18P56857 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Cldn18P56857 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Cldn18P56857 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Cldn18P56857 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Cldn18P56857 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Cldn18P56857 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Cldn18P56857 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Cldn18P56857 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Cldn18P56857 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Cldn18P56857 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Cldn18P56857 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Cldn18P56857 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Cldn18P56857 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Cldn18P56857 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
Cldn18P56857 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Cldn18P56857 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Cldn18P56857 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Cldn18P56857 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Cldn18P56857 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Cldn18P56857 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Cldn18P56857 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Cldn18P56857 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Cldn18P56857 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Cldn18P56857 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Cldn18P56857 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Cldn18P56857 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Cldn18P56857 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Cldn18P56857 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
Cldn18P56857 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Cldn18P56857 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Cldn18P56857 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Cldn18P56857 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Cldn18P56857 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
Cldn18P56857 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Cldn18P56857 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
Cldn18P56857 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Cldn18P56857 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Cldn18P56857 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Cldn18P56857 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Cldn18P56857 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
Cldn18P56857 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Cldn18P56857 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Cldn18P56857 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Cldn18P56857 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Cldn18P56857 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Cldn18P56857 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Cldn18P56857 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.8 ms