Protein–RNA interactions for Protein: P56392

Cox7a1, Cytochrome c oxidase subunit 7A1, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 80 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cox7a1P56392 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cox7a1P56392 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cox7a1P56392 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cox7a1P56392 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cox7a1P56392 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cox7a1P56392 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cox7a1P56392 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cox7a1P56392 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cox7a1P56392 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cox7a1P56392 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cox7a1P56392 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cox7a1P56392 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Cox7a1P56392 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Cox7a1P56392 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cox7a1P56392 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cox7a1P56392 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cox7a1P56392 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cox7a1P56392 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cox7a1P56392 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Cox7a1P56392 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cox7a1P56392 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cox7a1P56392 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cox7a1P56392 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Cox7a1P56392 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cox7a1P56392 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Cox7a1P56392 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
Cox7a1P56392 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16■□□□□ 0.15
Cox7a1P56392 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cox7a1P56392 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cox7a1P56392 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cox7a1P56392 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cox7a1P56392 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cox7a1P56392 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cox7a1P56392 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cox7a1P56392 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cox7a1P56392 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cox7a1P56392 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cox7a1P56392 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cox7a1P56392 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cox7a1P56392 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cox7a1P56392 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cox7a1P56392 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cox7a1P56392 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cox7a1P56392 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cox7a1P56392 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cox7a1P56392 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cox7a1P56392 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cox7a1P56392 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cox7a1P56392 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cox7a1P56392 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cox7a1P56392 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cox7a1P56392 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cox7a1P56392 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cox7a1P56392 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cox7a1P56392 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cox7a1P56392 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cox7a1P56392 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cox7a1P56392 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cox7a1P56392 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Cox7a1P56392 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cox7a1P56392 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cox7a1P56392 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cox7a1P56392 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cox7a1P56392 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cox7a1P56392 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cox7a1P56392 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cox7a1P56392 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Cox7a1P56392 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cox7a1P56392 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cox7a1P56392 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Cox7a1P56392 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cox7a1P56392 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cox7a1P56392 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cox7a1P56392 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cox7a1P56392 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cox7a1P56392 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cox7a1P56392 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cox7a1P56392 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cox7a1P56392 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cox7a1P56392 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cox7a1P56392 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cox7a1P56392 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cox7a1P56392 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cox7a1P56392 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cox7a1P56392 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cox7a1P56392 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cox7a1P56392 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cox7a1P56392 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cox7a1P56392 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cox7a1P56392 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cox7a1P56392 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cox7a1P56392 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cox7a1P56392 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cox7a1P56392 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Cox7a1P56392 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cox7a1P56392 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cox7a1P56392 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cox7a1P56392 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cox7a1P56392 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cox7a1P56392 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.3 ms