Protein–RNA interactions for Protein: P56183

Rrp1, Ribosomal RNA processing protein 1 homolog A, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 494 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rrp1P56183 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
Rrp1P56183 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Rrp1P56183 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
Rrp1P56183 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
Rrp1P56183 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
Rrp1P56183 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
Rrp1P56183 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Rrp1P56183 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Rrp1P56183 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Rrp1P56183 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Rrp1P56183 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Rrp1P56183 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
Rrp1P56183 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Rrp1P56183 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
Rrp1P56183 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Rrp1P56183 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
Rrp1P56183 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
Rrp1P56183 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Rrp1P56183 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
Rrp1P56183 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Rrp1P56183 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Rrp1P56183 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Rrp1P56183 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Rrp1P56183 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Rrp1P56183 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Rrp1P56183 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
Rrp1P56183 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Rrp1P56183 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
Rrp1P56183 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Rrp1P56183 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Rrp1P56183 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Rrp1P56183 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Rrp1P56183 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
Rrp1P56183 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Rrp1P56183 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Rrp1P56183 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Rrp1P56183 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Rrp1P56183 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Rrp1P56183 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Rrp1P56183 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
Rrp1P56183 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Rrp1P56183 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Rrp1P56183 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Rrp1P56183 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Rrp1P56183 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Rrp1P56183 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC25.54■■□□□ 1.68
Rrp1P56183 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Rrp1P56183 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Rrp1P56183 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Rrp1P56183 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC25.54■■□□□ 1.68
Rrp1P56183 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Rrp1P56183 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
Rrp1P56183 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
Rrp1P56183 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC25.53■■□□□ 1.68
Rrp1P56183 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
Rrp1P56183 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Rrp1P56183 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
Rrp1P56183 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Rrp1P56183 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
Rrp1P56183 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Rrp1P56183 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Rrp1P56183 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Rrp1P56183 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Rrp1P56183 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Rrp1P56183 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Rrp1P56183 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
Rrp1P56183 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Rrp1P56183 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Rrp1P56183 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Rrp1P56183 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Rrp1P56183 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Rrp1P56183 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
Rrp1P56183 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Rrp1P56183 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Rrp1P56183 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Rrp1P56183 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Rrp1P56183 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Rrp1P56183 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Rrp1P56183 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Rrp1P56183 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
Rrp1P56183 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Rrp1P56183 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Rrp1P56183 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Rrp1P56183 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Rrp1P56183 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Rrp1P56183 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Rrp1P56183 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Rrp1P56183 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Rrp1P56183 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Rrp1P56183 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Rrp1P56183 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Rrp1P56183 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Rrp1P56183 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Rrp1P56183 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Rrp1P56183 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Rrp1P56183 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Rrp1P56183 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Rrp1P56183 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Rrp1P56183 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Rrp1P56183 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 100.4 ms