Protein–RNA interactions for Protein: P51944

Ccnf, Cyclin-F, mousemouse

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Length 777 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CcnfP51944 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CcnfP51944 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CcnfP51944 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CcnfP51944 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CcnfP51944 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
CcnfP51944 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
CcnfP51944 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CcnfP51944 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CcnfP51944 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC21.78■■□□□ 1.08
CcnfP51944 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
CcnfP51944 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
CcnfP51944 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
CcnfP51944 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
CcnfP51944 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
CcnfP51944 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
CcnfP51944 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
CcnfP51944 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CcnfP51944 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CcnfP51944 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CcnfP51944 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CcnfP51944 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CcnfP51944 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CcnfP51944 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CcnfP51944 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CcnfP51944 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CcnfP51944 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CcnfP51944 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CcnfP51944 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CcnfP51944 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
CcnfP51944 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
CcnfP51944 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
CcnfP51944 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC21.74■■□□□ 1.07
CcnfP51944 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CcnfP51944 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CcnfP51944 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CcnfP51944 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CcnfP51944 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CcnfP51944 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
CcnfP51944 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CcnfP51944 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CcnfP51944 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CcnfP51944 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CcnfP51944 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CcnfP51944 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CcnfP51944 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CcnfP51944 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CcnfP51944 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CcnfP51944 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CcnfP51944 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CcnfP51944 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CcnfP51944 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
CcnfP51944 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CcnfP51944 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CcnfP51944 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CcnfP51944 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CcnfP51944 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CcnfP51944 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CcnfP51944 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CcnfP51944 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CcnfP51944 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CcnfP51944 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
CcnfP51944 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CcnfP51944 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
CcnfP51944 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CcnfP51944 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
CcnfP51944 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CcnfP51944 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CcnfP51944 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
CcnfP51944 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CcnfP51944 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC21.67■■□□□ 1.06
CcnfP51944 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CcnfP51944 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CcnfP51944 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CcnfP51944 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
CcnfP51944 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
CcnfP51944 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CcnfP51944 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CcnfP51944 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
CcnfP51944 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CcnfP51944 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
CcnfP51944 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC21.65■■□□□ 1.06
CcnfP51944 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CcnfP51944 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
CcnfP51944 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
CcnfP51944 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CcnfP51944 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CcnfP51944 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CcnfP51944 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CcnfP51944 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CcnfP51944 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CcnfP51944 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CcnfP51944 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CcnfP51944 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CcnfP51944 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CcnfP51944 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
CcnfP51944 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CcnfP51944 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
CcnfP51944 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CcnfP51944 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CcnfP51944 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.4 ms