Protein–RNA interactions for Protein: P51678

Ccr3, Probable C-C chemokine receptor type 3, mousemouse

Predictions only

Length 359 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccr3P51678 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ccr3P51678 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ccr3P51678 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ccr3P51678 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
Ccr3P51678 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ccr3P51678 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ccr3P51678 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ccr3P51678 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ccr3P51678 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ccr3P51678 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ccr3P51678 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ccr3P51678 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ccr3P51678 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
Ccr3P51678 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ccr3P51678 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ccr3P51678 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ccr3P51678 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ccr3P51678 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ccr3P51678 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ccr3P51678 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ccr3P51678 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ccr3P51678 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ccr3P51678 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ccr3P51678 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ccr3P51678 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ccr3P51678 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ccr3P51678 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ccr3P51678 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ccr3P51678 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ccr3P51678 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ccr3P51678 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ccr3P51678 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Ccr3P51678 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
Ccr3P51678 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Ccr3P51678 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Ccr3P51678 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Ccr3P51678 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Ccr3P51678 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ccr3P51678 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ccr3P51678 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ccr3P51678 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ccr3P51678 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ccr3P51678 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ccr3P51678 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ccr3P51678 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ccr3P51678 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ccr3P51678 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ccr3P51678 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ccr3P51678 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ccr3P51678 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ccr3P51678 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ccr3P51678 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ccr3P51678 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Ccr3P51678 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Ccr3P51678 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Ccr3P51678 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Ccr3P51678 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Ccr3P51678 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Ccr3P51678 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Ccr3P51678 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Ccr3P51678 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Ccr3P51678 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Ccr3P51678 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Ccr3P51678 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ccr3P51678 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ccr3P51678 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ccr3P51678 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Ccr3P51678 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Ccr3P51678 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Ccr3P51678 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Ccr3P51678 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Ccr3P51678 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Ccr3P51678 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Ccr3P51678 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Ccr3P51678 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Ccr3P51678 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Ccr3P51678 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Ccr3P51678 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Ccr3P51678 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Ccr3P51678 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Ccr3P51678 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Ccr3P51678 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Ccr3P51678 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Ccr3P51678 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
Ccr3P51678 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Ccr3P51678 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Ccr3P51678 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Ccr3P51678 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Ccr3P51678 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Ccr3P51678 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Ccr3P51678 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Ccr3P51678 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Ccr3P51678 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Ccr3P51678 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Ccr3P51678 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Ccr3P51678 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Ccr3P51678 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Ccr3P51678 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Ccr3P51678 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Ccr3P51678 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 139 ms