Protein–RNA interactions for Protein: P49813

Tmod1, Tropomodulin-1, mousemouse

Predictions only

Length 359 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmod1P49813 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Tmod1P49813 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Tmod1P49813 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
Tmod1P49813 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Tmod1P49813 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Tmod1P49813 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Tmod1P49813 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC25.14■■□□□ 1.62
Tmod1P49813 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Tmod1P49813 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Tmod1P49813 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.61
Tmod1P49813 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Tmod1P49813 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Tmod1P49813 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Tmod1P49813 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Tmod1P49813 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Tmod1P49813 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Tmod1P49813 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Tmod1P49813 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Tmod1P49813 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Tmod1P49813 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Tmod1P49813 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Tmod1P49813 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
Tmod1P49813 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Tmod1P49813 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Tmod1P49813 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Tmod1P49813 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Tmod1P49813 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Tmod1P49813 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Tmod1P49813 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
Tmod1P49813 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Tmod1P49813 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Tmod1P49813 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Tmod1P49813 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Tmod1P49813 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Tmod1P49813 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Tmod1P49813 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Tmod1P49813 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Tmod1P49813 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC25.08■■□□□ 1.61
Tmod1P49813 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Tmod1P49813 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Tmod1P49813 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
Tmod1P49813 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Tmod1P49813 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Tmod1P49813 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Tmod1P49813 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Tmod1P49813 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Tmod1P49813 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Tmod1P49813 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Tmod1P49813 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Tmod1P49813 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Tmod1P49813 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Tmod1P49813 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Tmod1P49813 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Tmod1P49813 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
Tmod1P49813 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
Tmod1P49813 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Tmod1P49813 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Tmod1P49813 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Tmod1P49813 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
Tmod1P49813 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
Tmod1P49813 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Tmod1P49813 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Tmod1P49813 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
Tmod1P49813 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Tmod1P49813 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Tmod1P49813 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
Tmod1P49813 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Tmod1P49813 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Tmod1P49813 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Tmod1P49813 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Tmod1P49813 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Tmod1P49813 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Tmod1P49813 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Tmod1P49813 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Tmod1P49813 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Tmod1P49813 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Tmod1P49813 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Tmod1P49813 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Tmod1P49813 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Tmod1P49813 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
Tmod1P49813 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Tmod1P49813 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Tmod1P49813 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Tmod1P49813 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Tmod1P49813 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Tmod1P49813 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
Tmod1P49813 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
Tmod1P49813 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC24.95■■□□□ 1.58
Tmod1P49813 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Tmod1P49813 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Tmod1P49813 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Tmod1P49813 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Tmod1P49813 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Tmod1P49813 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Tmod1P49813 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Tmod1P49813 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Tmod1P49813 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Tmod1P49813 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Tmod1P49813 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Tmod1P49813 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 446.6 ms