Protein–RNA interactions for Protein: P48787

Tnni3, Troponin I, cardiac muscle, mousemouse

Predictions only

Length 211 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnni3P48787 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
Tnni3P48787 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Tnni3P48787 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
Tnni3P48787 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
Tnni3P48787 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Tnni3P48787 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Tnni3P48787 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Tnni3P48787 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Tnni3P48787 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Tnni3P48787 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Tnni3P48787 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Tnni3P48787 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Tnni3P48787 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Tnni3P48787 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Tnni3P48787 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
Tnni3P48787 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
Tnni3P48787 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Tnni3P48787 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Tnni3P48787 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Tnni3P48787 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
Tnni3P48787 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Tnni3P48787 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Tnni3P48787 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Tnni3P48787 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Tnni3P48787 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Tnni3P48787 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Tnni3P48787 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Tnni3P48787 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Tnni3P48787 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Tnni3P48787 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Tnni3P48787 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Tnni3P48787 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Tnni3P48787 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Tnni3P48787 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Tnni3P48787 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Tnni3P48787 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Tnni3P48787 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Tnni3P48787 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Tnni3P48787 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Tnni3P48787 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Tnni3P48787 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Tnni3P48787 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Tnni3P48787 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Tnni3P48787 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Tnni3P48787 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Tnni3P48787 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Tnni3P48787 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
Tnni3P48787 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Tnni3P48787 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
Tnni3P48787 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Tnni3P48787 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Tnni3P48787 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Tnni3P48787 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Tnni3P48787 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Tnni3P48787 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Tnni3P48787 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Tnni3P48787 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Tnni3P48787 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Tnni3P48787 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Tnni3P48787 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Tnni3P48787 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Tnni3P48787 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Tnni3P48787 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Tnni3P48787 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Tnni3P48787 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Tnni3P48787 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Tnni3P48787 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Tnni3P48787 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Tnni3P48787 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Tnni3P48787 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
Tnni3P48787 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
Tnni3P48787 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Tnni3P48787 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Tnni3P48787 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Tnni3P48787 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
Tnni3P48787 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
Tnni3P48787 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Tnni3P48787 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Tnni3P48787 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Tnni3P48787 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Tnni3P48787 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Tnni3P48787 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
Tnni3P48787 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Tnni3P48787 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Tnni3P48787 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Tnni3P48787 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Tnni3P48787 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Tnni3P48787 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Tnni3P48787 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Tnni3P48787 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Tnni3P48787 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
Tnni3P48787 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Tnni3P48787 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Tnni3P48787 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Tnni3P48787 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Tnni3P48787 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Tnni3P48787 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Tnni3P48787 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Tnni3P48787 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Tnni3P48787 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.5 ms