Protein–RNA interactions for Protein: P48754

Brca1, Breast cancer type 1 susceptibility protein homolog, mousemouse

Predictions only

Length 1,812 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Brca1P48754 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Brca1P48754 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC26.54■■□□□ 1.84
Brca1P48754 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC26.54■■□□□ 1.84
Brca1P48754 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Brca1P48754 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Brca1P48754 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Brca1P48754 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Brca1P48754 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC26.52■■□□□ 1.84
Brca1P48754 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Brca1P48754 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Brca1P48754 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC26.51■■□□□ 1.83
Brca1P48754 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Brca1P48754 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.51■■□□□ 1.83
Brca1P48754 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Brca1P48754 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Brca1P48754 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
Brca1P48754 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
Brca1P48754 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Brca1P48754 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.49■■□□□ 1.83
Brca1P48754 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Brca1P48754 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC26.49■■□□□ 1.83
Brca1P48754 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC26.49■■□□□ 1.83
Brca1P48754 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Brca1P48754 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Brca1P48754 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC26.48■■□□□ 1.83
Brca1P48754 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
Brca1P48754 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Brca1P48754 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Brca1P48754 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Brca1P48754 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
Brca1P48754 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Brca1P48754 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Brca1P48754 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Brca1P48754 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Brca1P48754 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Brca1P48754 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Brca1P48754 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
Brca1P48754 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Brca1P48754 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC26.44■■□□□ 1.82
Brca1P48754 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Brca1P48754 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Brca1P48754 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Brca1P48754 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Brca1P48754 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Brca1P48754 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC26.43■■□□□ 1.82
Brca1P48754 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
Brca1P48754 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
Brca1P48754 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
Brca1P48754 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Brca1P48754 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Brca1P48754 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC26.4■■□□□ 1.82
Brca1P48754 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Brca1P48754 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Brca1P48754 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
Brca1P48754 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
Brca1P48754 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.81
Brca1P48754 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC26.39■■□□□ 1.81
Brca1P48754 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
Brca1P48754 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
Brca1P48754 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC26.38■■□□□ 1.81
Brca1P48754 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC26.38■■□□□ 1.81
Brca1P48754 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Brca1P48754 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
Brca1P48754 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
Brca1P48754 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC26.37■■□□□ 1.81
Brca1P48754 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC26.37■■□□□ 1.81
Brca1P48754 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Brca1P48754 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Brca1P48754 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Brca1P48754 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Brca1P48754 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Brca1P48754 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
Brca1P48754 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
Brca1P48754 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
Brca1P48754 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Brca1P48754 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
Brca1P48754 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
Brca1P48754 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC26.32■■□□□ 1.8
Brca1P48754 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
Brca1P48754 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
Brca1P48754 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Brca1P48754 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
Brca1P48754 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Brca1P48754 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Brca1P48754 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Brca1P48754 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Brca1P48754 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Brca1P48754 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
Brca1P48754 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
Brca1P48754 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC26.28■■□□□ 1.8
Brca1P48754 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Brca1P48754 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Brca1P48754 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Brca1P48754 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
Brca1P48754 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Brca1P48754 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Brca1P48754 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
Brca1P48754 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Brca1P48754 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Brca1P48754 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 65.4 ms