Protein–RNA interactions for Protein: P48725

Pcnt, Pericentrin, mousemouse

Predictions only

Length 2,898 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PcntP48725 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
PcntP48725 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
PcntP48725 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
PcntP48725 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
PcntP48725 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
PcntP48725 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
PcntP48725 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
PcntP48725 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
PcntP48725 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
PcntP48725 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
PcntP48725 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
PcntP48725 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
PcntP48725 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC24.46■■□□□ 1.51
PcntP48725 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
PcntP48725 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
PcntP48725 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
PcntP48725 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
PcntP48725 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
PcntP48725 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
PcntP48725 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
PcntP48725 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
PcntP48725 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
PcntP48725 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
PcntP48725 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
PcntP48725 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
PcntP48725 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
PcntP48725 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
PcntP48725 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC24.39■■□□□ 1.5
PcntP48725 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
PcntP48725 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
PcntP48725 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
PcntP48725 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
PcntP48725 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
PcntP48725 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
PcntP48725 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
PcntP48725 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
PcntP48725 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
PcntP48725 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
PcntP48725 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
PcntP48725 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
PcntP48725 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
PcntP48725 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
PcntP48725 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC24.35■■□□□ 1.49
PcntP48725 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
PcntP48725 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
PcntP48725 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
PcntP48725 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
PcntP48725 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
PcntP48725 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
PcntP48725 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
PcntP48725 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
PcntP48725 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
PcntP48725 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
PcntP48725 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
PcntP48725 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC24.32■■□□□ 1.48
PcntP48725 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
PcntP48725 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
PcntP48725 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
PcntP48725 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC24.31■■□□□ 1.48
PcntP48725 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
PcntP48725 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
PcntP48725 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
PcntP48725 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
PcntP48725 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
PcntP48725 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
PcntP48725 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
PcntP48725 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
PcntP48725 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
PcntP48725 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
PcntP48725 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
PcntP48725 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
PcntP48725 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
PcntP48725 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
PcntP48725 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
PcntP48725 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
PcntP48725 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
PcntP48725 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
PcntP48725 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
PcntP48725 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
PcntP48725 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
PcntP48725 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
PcntP48725 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
PcntP48725 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
PcntP48725 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
PcntP48725 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
PcntP48725 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
PcntP48725 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
PcntP48725 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
PcntP48725 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
PcntP48725 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
PcntP48725 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
PcntP48725 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
PcntP48725 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
PcntP48725 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PcntP48725 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
PcntP48725 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
PcntP48725 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
PcntP48725 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
PcntP48725 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
PcntP48725 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.2 ms