Protein–RNA interactions for Protein: P48432

Sox2, Transcription factor SOX-2, mousemouse

Predictions only

Length 319 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sox2P48432 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Sox2P48432 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
Sox2P48432 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Sox2P48432 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Sox2P48432 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Sox2P48432 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Sox2P48432 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Sox2P48432 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Sox2P48432 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Sox2P48432 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Sox2P48432 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Sox2P48432 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Sox2P48432 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Sox2P48432 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Sox2P48432 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Sox2P48432 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Sox2P48432 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Sox2P48432 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Sox2P48432 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
Sox2P48432 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Sox2P48432 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Sox2P48432 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Sox2P48432 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Sox2P48432 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Sox2P48432 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Sox2P48432 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Sox2P48432 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Sox2P48432 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Sox2P48432 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Sox2P48432 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
Sox2P48432 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Sox2P48432 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Sox2P48432 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Sox2P48432 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Sox2P48432 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Sox2P48432 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Sox2P48432 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Sox2P48432 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Sox2P48432 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Sox2P48432 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.99
Sox2P48432 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
Sox2P48432 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Sox2P48432 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Sox2P48432 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Sox2P48432 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Sox2P48432 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Sox2P48432 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Sox2P48432 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Sox2P48432 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Sox2P48432 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Sox2P48432 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Sox2P48432 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Sox2P48432 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Sox2P48432 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Sox2P48432 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Sox2P48432 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Sox2P48432 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
Sox2P48432 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Sox2P48432 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Sox2P48432 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Sox2P48432 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Sox2P48432 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Sox2P48432 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Sox2P48432 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Sox2P48432 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Sox2P48432 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Sox2P48432 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Sox2P48432 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Sox2P48432 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Sox2P48432 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Sox2P48432 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Sox2P48432 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Sox2P48432 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Sox2P48432 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Sox2P48432 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Sox2P48432 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Sox2P48432 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Sox2P48432 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Sox2P48432 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Sox2P48432 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Sox2P48432 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Sox2P48432 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Sox2P48432 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Sox2P48432 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Sox2P48432 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Sox2P48432 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Sox2P48432 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Sox2P48432 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Sox2P48432 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Sox2P48432 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Sox2P48432 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Sox2P48432 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Sox2P48432 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Sox2P48432 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Sox2P48432 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Sox2P48432 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Sox2P48432 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Sox2P48432 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Sox2P48432 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Sox2P48432 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.6 ms